裕去世，孝宗皇帝马上就任命了他的亲信屠滽，接任了吏部尚书。
随后在四月，修改开中法的户部尚书叶淇，被孝宗勒令致仕，让当时的户部左侍郎周经，接替了户部尚书的位置。
就这样，孝宗皇帝不停地将自己的亲信部下，安插在六部之中。
到了弘治九年底，除了兵部尚书马文升是内阁死党，孝宗皇帝动之不得之外，其他五部尚书，都已经换上了孝宗自己的人。
也是在这时，孝宗才开始亲征掌权。
但也就是在这一年，孝宗的皇次子朱厚炜，年仅三岁，就在皇宫里莫名其妙的薨逝了。
死因不明，史书中并未记载。
孝宗掌控六部之后，又开始想要染指北方军政。
弘治十年，孝宗皇帝起复威宁伯王越，并加太子太保，总制甘、凉边务兼巡抚，其后兼制延、宁两镇。
这样一来，西北的军权，就集中到了王越一个人的手中。
孝宗皇帝又控制了京城的朝政，又掌控了西北的军权，于是他开始对内阁动手。
弘治十一年七月，孝宗皇帝接连将内阁首辅徐溥，户部侍郎刘大夏，和南京户部尚书秦紘，全部免职。
然后派出太监莫英，宋裕，刘璟等人，开始清查京城及通州两地的粮仓。
众所周知，明朝的皇帝只要一查账，那什么意外都有可能发生。
运气好一点的，像是武宗皇帝，只是易溶于水而已。
运气差一点的，像是英宗皇帝，就要被这土木堡之变，留下一世骂名了。
孝宗皇帝也一样，因为这帐就根本没法查。
孝宗继位时，趁着权力真空期，内阁把粮仓监粮的太监，全都撤掉了。
没了太监的监督，这些文官不是想做什么就做什么吗？
现在过去了十一年，京城和通州粮仓的亏空，那简直无法想象。
孝宗皇帝要倒查十一年的旧账，那前内阁首辅徐溥，前兵部尚书马文升，前户部尚书叶淇，有一个算一个，一个都跑不掉，全都得死！
户部极力阻止尚书周经等人，极力阻止孝宗皇帝查账，上书“生一事则有一事之害，增一官则有一官之费。”
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