在又一次艰难战胜使徒后，大雄、哆啦a梦、胖虎和静香驾驶着eva机体返回了nerv总部。
一路上，大家都沉浸在胜利的疲惫与对使徒不断变强的担忧之中。
回到总部，科研人员们如往常一样，迅速对蜘蛛使徒的残骸展开了细致的研究，而大雄他们则拖着疲惫的身躯走向休息区。
胖虎一屁股坐在长椅上，揉着自己酸痛的胳膊，抱怨道：“哎呀，这些使徒是越来越难对付了，每次都把我累得够呛。”
静香无奈地看了他一眼，说：“胖虎，你就别抱怨了，大家都很累呀。而且你也看到了，这次的使徒又出现了新的能力，真不知道以后还会遇到什么样的怪物。”
大雄坐在一旁，眼神有些迷茫，低声说：“我一直在想，为什么使徒会越来越强大，而且每次都有新的变化呢？还有它们身上那些奇怪的特征，比如上次那个章鱼使徒有类似人类基因的东西，这次这个蜘蛛使徒又能自我修复，这背后到底隐藏着什么秘密啊？”
哆啦a梦也皱着眉头，从四次元口袋里掏出几个能量补充小零食，分给大家，说：“我也不清楚，但我觉得这些问题肯定不简单。也许我们得找个机会和碇司令或者其他更了解这个世界秘密的人好好聊聊，说不定能得到一些线索呢。”
就在这时，绫波丽走了过来，她看着众人疲惫又有些忧虑的神情，轻声说：“你们这次表现得很不错，又成功击退了使徒。不过，我知道你们心里有很多疑问，关于使徒的，也关于这个世界的。如果你们愿意的话，可以等会儿来我的房间，我或许能和你们说一说我所知道的一些事情。”
大雄他们对视一眼，眼中都闪过一丝惊讶和期待，大雄连忙说：“好呀好呀，绫波丽姐姐，那我们等会儿就去找你。”
休息了一会儿后，四人便来到了绫波丽的房间。绫波丽的房间布置得很简洁，只有一些基本的生活用品和几本书。
众人坐下后，绫波丽看着他们，缓缓开口道：“其实，关于使徒，我们nerv也一直在研究，但很多事情至今仍然是谜团。就像你们发现的，使徒身上出现的类似人类基因的情况，以及它们不断变强和拥有各种奇怪能力的现象，都让人觉得它们和人类之间似乎有着某种深层