后夹击，朝鲜水军远距离遭铁炮及弓箭密集射击，接弦时又遭焙烙玉投掷，火起于甲板，船身也多处炸裂。日军趁机登舰夺船，在陆师战无不胜的士气加持下，大肆杀戮朝鲜官兵，后续批次则掩护射击，一时之间朝鲜水军大溃。
元均见大势已去，下令撤退，并传令向全罗道左水使李舜臣求援。元均重整船阵，以火炮齐射日军主力安宅舰，导致两艘安宅受损。
然而，此时朝鲜水军方面挟船及鲍作已然溃散，官兵弃船，元均领多艘板屋失去协护，立刻便遭日军小早船袭扰。他眼下对于关船及小早船的麻烦在于，板屋火炮难以瞄准，仅能以弓箭抵挡，但敌趁朝鲜被牵制之时，船队逼近以火绳枪速射，由于板屋船动作迟钝，官兵屡遭射击。
藤堂高虎以关船接弦板屋，再掷焙烙，登舰作战，元均实在没什么好法子可想，因此不敌，且战且退，终领四艘板屋船突围而出，而朝鲜水军其余战船均被日军俘获。
藤堂高虎见状大笑，道：“若朝鲜水军皆是如此，我军数月之内便能夺占全部港口，劫掠物资。来人，传报九鬼嘉隆殿下，就说藤堂队遭遇朝鲜水军主力，大获全胜，朝鲜西岸畅通无阻！”
说罢，遂令兵分两路，一路继续追击元均残部，一路夺占港口，休整船队。
九鬼嘉隆听闻藤堂高虎大胜，也是喜不自胜：“藤堂神勇！我原以为朝鲜水军训练有素，不可轻敌，未想竟如此不堪一击，由此可见我军海路无忧也。
朝鲜军备羸弱至此，归太阁殿下统御也是天命所归了。不过，未雨绸缪总归要有，眼下急需探查明国水军情报，以备万一，诸位应当谨记……只有明国才配得上我军之对手！”众将轰然应是。
元均此后退至巨济岛一带徘徊，与敌周旋，后接到李舜臣回信，信中却道“勿令妄动”四字。元均大怒，愤慨李舜臣不予援救。
其实李舜臣与元均相识已久，但彼此却深有矛盾，元均见李舜臣不救，认定李舜臣公报私仇。如今日军逼近，元均立即撤出巨济岛，往全罗道丽水港而去，欲向李舜臣问罪。
李舜臣字汝谐，也已四十有七，自幼习武，研修兵法，然性情耿直，屡犯上官，多有不睦，因此仕途坎坷。
不过其治军有方，万历十九年