口头通知他们到中途岛待命，一共超过三百艘的潜艇集结在中途岛待命。
尼米兹又把三艘战略级飞艇也携带无线设备偷偷布置到了中途岛上空，为了迷惑日军，派出三艘普通军舰在珍珠港后方冒充三艘航母进行通讯。
日军方面的玩家曾经几次向山本和南云明示美军已经掌握日军密码，这三艘航母会在6月3日前就到达中途岛以逸待劳，但山本和南云直接将这几个玩家打发去清洗航母甲板。
6月2日佯攻阿留申的两艘航母被美军潜艇重创，坚定了山本南云攻击中途岛的决心，6月3日高空的飞艇发现日军6艘航母都进入埋伏圈后，首先由水上飞机组群飞过勾引日军注意力。
再以每50艘潜艇攻击一艘航母开始饱和的鱼雷攻击。
航母的歼击机则是在飞艇的无线电指挥下将300艘战机逐个攻击航母，到6月7日，日本参战的8艘航母和100艘日本各类军舰，还有近500架飞机被炸进了海底，日本海军部受到毁灭性打击，完全失去太平洋控制权。