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王珣急命休整的刘牢之的兵马赶往寻阳，三天后刘牢之率军抵达寻阳。好消息是对方的水军并未抵达，而是在上游的江中游弋，似乎是在等待机会和补给。
而王珣不敢停留，于数日后退回寻阳。五月初，王珣兵马退回历阳郡休整。
夏口之战，双方投入兵马十余万，阵亡数万兵马，伤者数万，可谓惨烈之极。但最终，却落得个无功而返，白白死伤了那么多兵马。
经此一战，朝廷兵马遭受重创，进攻受阻。而桓玄的兵马也遭到了毁灭性的打击。兵马锐减到了两万余人，元气大伤。一时间，双方都无力再战，只得僵持对峙。