“而第二代测序是运用ila技术,将dna进行碎片化,通过固定之后进行桥式pcr形成簇状结构,随后用不同荧光基团对atcg碱基进行标记,根据荧光信号确认新合成的dna单链时连接上去的碱基。”
“说起来复杂,其实很简单,就是将大片的分成小片,然后完成测序后根据序列信息进行拼接。”
“而第三代测序技术则在前两种测序技术上又有了突破,无需进行pcr扩增,直接在单分子上进行测序。我之前所运用的srt或nanopore技术就是基于边合成边测序的思想,通过四种荧光标记四种碱基,然后通过光的波长和峰值判断是何种碱基。”
说到这里,陆时羡已经简单把前三代的测序原理都简单介绍了一下。
他这当然不是在浪费时间,而是为了有的放矢,为后面的叙述进行铺垫。
“通过与水稻基因组相似性的比较过程中,我们发现如果这种新型禾本科植物的叶绿体基因功能非常出色,而叶绿体的功能大家都很清楚,是通过光合作用合成淀粉的场所,但在生长发育分化基因方面的功能却远不如水稻。”
“因此,我们小组有了一个设想,是不是能够通过第三代测序技术,将这种禾本科植物的高质量染色体水平基因组重新进行组装。通过夜以继日的努力,我们初步组装了1个212gb大小的染色体级别基因组,其中包含有12条伪染色体和29098个编码蛋白质的基因。”
说到这里,很多人脸上已经变得有些莫名。
因为很多人意识到,不提陆时羡得到的实验结论,光凭这个实验方法就已经是一个极大的科研成果。
没错,在科学研究中,不仅仅只有实验结果可以发论文,一种可以被广泛使用的研究工具或者说方法也可以。
既然这种禾本科植物可以用三代测序技术进行重组,那我换成豆科、木兰科、蔷薇科,或者说直接改换成动物或者微生物,岂不是也能使用这个组装方法?
这一刻,几乎所有人眼前都仿佛看见论文在朝自己招手。
不过此时并没有到提问时间,所有人都在等着陆时羡说完。
“通过系统发育和比较基因组比较分析,发现这种植物与水稻