随着倭寇重新退回大海之上，嘉靖三十一年四月起，劫掠浙江各府的倭患算是暂时平息了。
而在北京城里，那位至尊，也因此事大发雷霆后，大明朝廷的办事效率终于有了些许起色。
“你们再琢磨琢磨，要是没有纰漏，那我们就这么报上去。”
位于北京紫荆城东面的文渊阁内，严嵩、吕本和新晋阁臣徐阶坐在上首，六部尚书居于下正在商量政务。
明朝最初沿袭元朝制度，设立中书省，置左、右丞相，但之后在胡惟庸案后，朱元璋罢中书省和宰相，权利回归六部。
之后，又置文华殿大学士，为其顾问，这就是内阁的雏形。
而之后在朱棣登基称帝后，一开始也是殚精竭虑，但屡次北征让他感觉难以总揽政事，于是内阁制度应运而生。
阁臣之预务自此始，然其时，入内阁者皆编、检、讲读之官，不置官属，不得专制诸司。诸司奏事，亦不得相关白。
这个时候的内阁，还仅仅充当朱棣秘书的角色。
又是数位皇帝后，内阁权势才逐渐坐大。
内阁大臣的建议是写在一张纸上，贴在奏章上面，这叫做“票拟”，而皇帝用红字做批示，称为“批红”。
不过在宣宗时，皇帝批红成了象征，他直接把权利下方到了司礼监，由此有了内、外庭分治的说法。
明朝内廷、外廷的机构完全对称，外有内阁，内有司礼监，外有三法司，内有东厂、锦衣卫，外廷有派往地方的总督、巡抚，而内廷派往地方的也有镇守太监、守备太监等等。
这样，内廷、外廷相互制约，才能确保皇帝的决策地位。
但是，这也造成了内外两大政治势力的争权夺利。
“革浙江布政司参政曹汴职，回籍听勘；停参议李宠、按察司佥事李廷松俸，下按臣逮问没有问题。
可浙江巡按御史林应箕四月奏倭寇事，参海道副使李文进、分巡副使谷峤等官员尸位素餐，当时推海道副史丁湛，并都指挥张鉄备倭，该办办，陛下的意思不能违逆。
可是这条陈，丁湛罢为民，以李文进代之，张鉄革回原卫，以周应桢代之，种种，就是对四月处置的完全翻转，有失体统。”