如今耶稣会在江南最重要的传教中心就是此次郭居静来接收的位于南京的户部宅子。
这宅子本来利玛窦都买不到，此地乃是当年南京公布花巨资为户部官员所建造的宿舍，可是建好之后却传说这宅子闹鬼，两三年都没人敢去住。当时利玛窦正在南京找教堂的地址，南京工部尚书刘斗墟就把这处大明手上的烂尾官方资产忽悠卖给了利玛窦，并且只收了造价的一半。
利玛窦心态倒也乐观，到新房做了一痛的驱魔仪式之后就招呼耶稣会士住进去，后来的耶稣会士倒是对这处宅子非常满意，在笔记中夸奖这屋子说：“它座落在城里最高的地段，不怕淹水，并且位于大街上，大街有一投石的宽度，在这里可以看到皇宫和各部衙门”。
而买下这处宅子之后，利玛窦不怕鬼的故事也传遍南京城，顺便也帮助了他在南京传教。
章湟介绍说：“郭居士虽然是方外之人，但在中华文字的音韵学上颇有研究。”
郭居静笑着解释：“耶稣会为了能够进入中华，需要想办法学习中华的语言文字，中文博大精深，掌握十分困难，特别是音调不易领会，我曾经在意大利学过音乐，发现汉字的声调一共有五种不同的音调或变音，可以用音乐的音程加以表示。”
“郭先生果真见识广博。”王文龙由衷赞叹，因为郭居静发现的音调标记法不仅适用于汉语，还启蒙了后世几乎所有带音调的语言如何标记拼音文字。
第一部欧洲人所写的中文字典，是十多年前由利玛窦和罗明坚共同在广东肇庆编写的《葡汉词典》，其中使用了最早的汉语拼音方案，只不过这种拼音的声韵母设计非常不科学，大量字词拼出来都有歧义，后来利玛窦又在大明音韵学家的帮助下改进他的拼音方案，直到对音乐极有特长的郭居静参与拼音设计，利玛窦才发现汉字的声调原来就是音调。
而且和传统认为汉字只有平上去入四声不同，郭居静依照他的音乐特长，发现此时的官方语言的南京官话有五种声调，有此发现后，去年利玛窦使用拼音加声调的方案在北京出版了《西字奇迹》一书。
利玛窦、郭居静等人为了传教对于中文语音的研究相当深入，实际上成为了中文拼音的第一批实践者。他们本来就来自使用拼音文字