主要的原因就是顾宪成反对佛道思想进入儒学，认为心学和理学都因为佛教的影响而变成空谈。
当顾宪成听到王文龙对于中华文明以人为本的解释，顿时便有知己之感。
等到送走王喜，顾宪成便叫来弟子道：“你去打听打听，王建阳近日是不是都在南京？”
……
顾宪成轻车简从在两个弟子的陪伴之下，来到了王文龙为南京的宅子。
顾宪成在书房中坐下，便笑着说道：“建阳，我听王公公说了，你关于中华宗教之论，颇以为然。想请你仔细讲讲以人为本这四个字。”
王文龙回答道：“我以为颛顼绝地天通之时，已经将宗教控制人心的部分尽量削弱，所留下来的部分则是为了让百姓在痛苦生活之中可以有个信仰归宿，也就是我等所说神道设教的意思。这和其他文明奉某神为文明中心的思想迥然不同。中华文明自古以来便脚踏实地，早早认识到一切问题是由人产生，也必须由人去解决，而不能寄托于宗教，正如经典所言：子不语怪力乱神，这便是我提出以人为本的意思。”
顾宪成听的满脸欣赏，笑着说道：
“建阳这话说的好，一切的宗教目的都是为了服务日用民生，宗教只归宗教，就是为了解决百姓信仰无着而出现的，如今天主教入华是因为此理，当年引入佛教也是为了此理。只可惜佛教中生出一派禅宗，远离了百姓日用只去谈玄论道，这便是走上歧途了。”
顾宪成这群东林党人总拿着禅宗当靶子打，主要原因是他们反对儒家的理学、心学引入了禅宗思想之后出现的“修身”主张。顾宪成认为儒家原本的思想应该是治国齐家平天下，但是治国平天下的大愿太难达成，于是当王阳明提出只要修养心性人人都可以成为圣人的主张之后，不少儒生就选择钻研心学，不再去想什么家国天下，而是只修炼自己的心性道德。
东林党斥责这种做法为“闭眼谈心性”，消极避世，对世界上种种需要改革的事情视若无睹。
在此基础上顾宪成反对“不学不虑”和“出世”，故而强调治世，号召所有儒家学者都去参与政治，提出“天下之士非当自之天下”的口号。但是参与政治哪是那么简单的？单个的儒家学者想要参与政治必须抱团取暖，而