首先，股权结构复杂且高度集中。根据“企查查”的股权结构图显示，公司最大股东为杭州市上城区文商旅投资控股集团有限公司，持股46，而宗庆后及其家族成员合计持股约54。这种高度集中的股权结构使得公司在决策过程中容易受到大股东意志的影响，不利于中小股东利益的保护和公司治理的透明化。
其次，管理层更替缺乏制度保障。在宗庆后去世后，娃哈哈董事长人选一直空缺，这使得公司的管理层更替缺乏明确的制度保障和程序规范。宗馥莉虽然作为副董事长和总经理接管了公司，但其权威性和合法性并未得到所有股东和管理层的认可和支持。这种不确定性不仅影响了公司的正常运营和发展规划，也加剧了内部矛盾和冲突。
最后，家族文化与职业管理的冲突。在家族企业中，家族文化往往成为公司治理的重要因素之一。然而，随着企业规模的扩大和市场竞争的加剧，家族文化与现代职业管理之间的冲突日益凸显。宗馥莉在接管公司后试图引入更加现代化、市场化的管理理念和方法，但这种尝试往往受到家族成员和传统管理模式的阻碍和抵制。这种冲突不仅影响了公司的管理效率和创新能力，也加剧了宗馥莉的工作压力和挫败感。
三、娃哈哈的未来之路：变革与重生
面对宗馥莉的辞职风波和公司治理结构的挑战，娃哈哈集团必须深刻反思并寻求变革之路以实现重生。
首先，优化股权结构并加强公司治理。娃哈哈集团应该通过引入战略投资者、实施股权激励等方式优化股权结构并降低大股东持股比例；同时建立健全的公司治理机制包括董事会、监事会和股东大会等制度规范以确保决策的科学性和透明度；此外还应该加强内部控制和风险管理以防范潜在的经营风险。
其次，明确战略定位并推动转型升级。娃哈哈集团应该根据市场环境和消费者需求的变化明确自身的战略定位和发展方向；同时加大研发投入并推动产品和服务的创新升级以满足消费者日益多样化的需求；此外还应该积极探索新的业务领域和市场机会以实现多元化发展并降低经营风险。
最后，加强人才培养和引进并构建企业文化。娃哈哈集团应该注重年轻人才的培养和引进并为其提供良好的发展平台和晋升机会；