品行高洁，是担当大任的理想人选，于是决定将其纳入朝中，委以重任。
方孝孺被任命为翰林侍讲及翰林学士，这两个职位在明朝的文官体系中占据举足轻重的地位，负责为皇帝讲解经史、起草诏令等重要事务。在文渊阁，他更是受到了皇帝如同师长般的尊敬与信任，经常被召至御前讨论国事，参与决策，这在当时是极为罕见的殊荣。方孝孺以他的渊博学识和正直品格，逐渐成为朱允炆身边不可或缺的智囊与精神支柱，对朝政产生了深远影响。
在文化与学术建设方面，方孝孺的贡献尤为显着。他作为副总裁，积极参与了《太祖实录》和《类要》等重要历史文献的纂修工作。《太祖实录》旨在记录明朝开国皇帝朱元璋的生平事迹与治国方略，而《类要》则是一部涉及广泛知识领域的类书，这两项工程的完成，不仅对保存历史记忆、总结前朝经验具有重要意义，也进一步巩固了方孝孺在史学界的地位。他严谨的治学态度和对史料的精准把握，确保了这些文献的权威性和准确性，对后世研究明代历史提供了宝贵资料。
此外，方孝孺还肩负起了主持科举考试的重任，即京考。在那个时代，科举是选拔官员的主要途径，主持考试意味着掌握了为国家选拔栋梁之才的钥匙。方孝孺以其公正无私的态度和对人才的敏锐识别能力，为明朝选拔了一大批德才兼备的官员，极大地促进了文化教育事业的发展，也为朝廷注入了新的活力。
三、忠烈千秋：不屈不挠，以死明志
“靖难之役”是明朝历史上的一次重大转折点，它不仅改变了皇权的归属，也深刻影响了无数人的命运，方孝孺便是其中最为悲壮的例子。当燕王朱棣以“清君侧”的名义起兵南下，其目标直指皇位，而明惠宗朱允炆的政权在内外交困中逐渐崩溃。1402年，朱棣攻破南京，标志着“靖难之役”的胜利结束，同时也拉开了新皇权确立的序幕。
面对这场剧变，许多原先效忠于惠宗的官员纷纷改换门庭，以求自保。然而，方孝孺却选择了另一条路。作为惠宗的忠实支持者和精神导师，他坚守儒家忠君爱国的理念，拒绝向新政权低头。当朱棣欲借方孝孺之手起草即位诏书，以示正统，方孝孺却以死相拒，坚决不为篡位者提供任何合法性。据史书记载，方孝孺在殿