军事系统内部的不满与混乱。同时，由于社会经济问题和官府压迫，多地农民起义不断，进一步动摇了明王朝的根基。
面对危机，明世宗末期也出现了力挽狂澜的迹象。戚继光、俞大猷等将领在东南沿海抗击倭寇，取得了显着的战果。尤其是戚继光领导的戚家军，通过台州大捷等一系列战役，大大削弱了倭寇的势力，最终在嘉靖四十四年与俞大猷合作，彻底扫平了广东、南澳的倭寇，保障了东南沿海的安全，稳定了社会秩序。
六、阁臣纷争
嘉靖中后期，明世宗朱厚熜对朝政的控制逐渐放松，转而沉溺于道教修炼，追求长生不老，这一时期，奸臣严嵩的崛起成为明朝政治的一大污点。严嵩以其狡猾的手段和对皇帝的谄媚，逐步攀升至权力的巅峰，对国家造成了极大的损害。
严嵩于嘉靖二十一年（1542年）进入内阁，随着其地位的稳固，他开始排除异己，其中最着名的是对曾任内阁首辅的夏言的诬陷，最终导致夏言被杀。严嵩在嘉靖二十七年（1548年）再次担任内阁首辅后，几乎独揽朝政长达十五年。为了讨好痴迷道教的明世宗，严嵩不惜代价支持修建斋宫秘殿，工程浩大，劳民伤财，严重消耗了国家的财政资源，年费高达二三百万两，远超国库年收入，给国家经济造成了沉重负担。
在政治上，严嵩手段残忍，对于任何敢于弹劾他的官员，不论是轻是重，他都会无情打击，轻则罢官，重则置人于死地，这使得朝中正直之士噤若寒蝉，政治风气极度恶化。嘉靖三十一年（1552年）后，严嵩的权势达到顶峰，几乎无人敢撄其锋。
然而，权力的平衡并非永恒不变。嘉靖四十一年（1562年），局势出现了转机。邹应龙勇敢地上书揭露严嵩父子的罪行，明世宗终于下令逮捕严世蕃，勒令严嵩退休。徐阶，作为严嵩的政敌，以其谨慎的策略和对时机的精准把握，逐渐赢得明世宗的信任，并在严嵩失势后接替其成为内阁首辅。徐阶主持重建了因火灾损毁的永寿宫，并将其命名为万寿宫，这一工程的顺利完成，进一步巩固了他的地位，而严嵩则彻底退出了政治舞台，其子严世蕃也在嘉靖四十四年（1565年）被处决。
七、晚年
明世宗朱厚熜的晚年，随着年岁的增长及