成法的实施、一条鞭法的推广，以及加强边防等，使得明朝在一定程度上恢复了活力，开创了所谓的“万历中兴”。
四、太岳辅政
张居正出任内阁首辅后，朱翊钧将朝廷大权几乎全数托付给了他，同时将内廷事务交由冯保处理，形成了“外有张居正，内有冯保”的格局。朱翊钧对张居正的尊重与信任，表现在日常言辞中，他总是以“元辅张先生”或“张先生”相称，这种尊称在古代中国极为罕见，显示出他对张居正的极高评价。1572年六月，即张居正就任不久，朱翊钧便在平台单独召见张居正，这在明穆宗在位期间从未发生过，此举极大地提升了张居正的政治地位，同时也向朝臣们展示了朱翊钧决心治理国家的态度。
在朱翊钧的支持下，张居正展开了全方位的改革，首先在政治层面，推行了“考成法”。这是一种旨在整顿官僚系统，提高行政效率的制度，要求官员必须在规定时间内完成任务，实行层层监督，确保责任到人。张居正通过考成法，有效地减少了官僚主义和文牍主义，使政府运作更加高效，增强了皇权的权威。朱翊钧虽然年幼，对祖制并不十分了解，但对张居正的信任让他在改革中发挥了关键作用。
在经济领域，张居正推动了两项重要改革：一是全国范围内的土地清丈，二是“一条鞭法”的推广。1578年，福建行省率先开始土地清丈的试点，两年后，这一工作在福建宣告完成。随后，朱翊钧与张居正决定将清丈推广至全国，户部为此制定了详细的实施规定，到1582年底，全国的土地清丈基本完成，新增田地一百四十余万顷。同时，“一条鞭法”作为一种简化赋税征收方式的改革，也在1581年全面推广，极大地减轻了农民负担，增加了政府收入，标志着张居正改革的重大胜利。
万历朝的前十年，朱翊钧与张居正的合作，使明朝政治面貌焕然一新，经济状况明显改善，为明朝中期的繁荣奠定了基础。然而，1582年张居正病逝，朱翊钧开始亲政，标志着一个时代的结束。在亲政后，朱翊钧主持了“万历三大征”，即宁夏之役、朝鲜之役和播州之役，这些军事行动虽然巩固了边疆安全，但耗资巨大。不过，据记载，这些军费是由内帑和太仓库银足额拨发，即便在三大征结束后，国库仍有剩余，