兆熊精心布置的陷阱。在通往叛军必经之路的峡谷中，吕兆熊预先放置了装有信鸽的银匣子，一旦叛军接近，信鸽便会飞出，向官军传递信息。当叛军进入峡谷，官军占据高地，利用地形优势发起突袭，大石如雨，叛军措手不及，损失惨重。首领哱承恩身负重伤，叛军自此不敢轻举妄动，固守城内，内外交困。
叛军内部开始出现分裂，刘东旸杀害了土文秀，哱承恩又杀了许朝，随后周闰柱又将刘东旸杀害，军心大乱。吕兆熊抓住叛军内讧的机会，一举攻破银川城，迫使叛军投降。乱首哱拜阖门自尽，哱承恩等主要叛军头目被擒，宁夏之乱终被平定。
吕兆熊的军事才能和政治智慧在这场平叛战役中展现得淋漓尽致，他不仅挽救了西北边疆的危机，也为明王朝立下了赫赫战功。万历帝对其嘉奖有加，吕兆熊的官职因此屡次晋升，成为当时备受推崇的军事家和政治家。平定宁夏叛乱，不仅是万历朝的一项重大军事行动，也成为了明朝历史上一段佳话，吕兆熊的名字也因此被载入史册，成为后世歌颂的英雄。