时，谢升不慎批评了崇祯帝过于自负，过于依赖个人判断，导致国家陷入危机。他还透露了崇祯帝在奉先殿祈签后决定议和的内情，这被认为是泄露了宫廷机密。科道官们听闻此言，立即上报，弹劾谢升“归罪天子”，“诽谤君父”，“泄禁中语”，“大不敬”。
崇祯帝对此极为愤怒，下令对谢升进行议处。同时，言官米寿图在弹劾兵部郎中张若麒时，也将矛头指向了谢升，指控他是张若麒背后的庇护者。面对众多弹劾，崇祯帝原本意图严惩谢升，但鉴于朝中大量官员附和弹劾，且崇祯帝用人往往呈现出“弹章愈多，位愈固”的反比现象，最终决定从轻发落，仅将谢升削籍为民，保留了他的一线生机。
四、降清去世
崇祯十七年（1644年），大明王朝的最后岁月，李自成领导的农民起义军攻陷北京，大明的统治土崩瓦解。在这一混乱局面中，谢升展现出了一种复杂的行为模式。当李自成的部队派遣吴征文、阎杰镇守德州时，谢升竟然发动了一场反抗，将他们杀害，并扶植被囚禁在德州的庆王后裔、香河知县朱帅为济王，试图在乱世中寻求一种新的政治定位。
然而，不久之后，清军入关，历史的车轮继续向前滚动。谢升与同籍御史赵继鼎、卢世等人，在同年六月向清廷递上了降表，表明了归顺之意。在表文中，谢升不仅详述了自己的起兵经历，还恳请清廷能够“兴灭继绝”，延续明室的祭祀。清廷对谢升的态度表示了宽容，采纳了王鳌永的建议，恢复了谢升的原有官职，显示了其对前明官员的招抚政策。
谢升于八月二十七日抵达北京，随即被纳入清廷的内三院，与冯铨、洪承畴等共同处理政务，成为清廷统治机构中的一员。尽管谢升曾以年迈为由请求退休，但清廷出于对他的重视，予以挽留。在清廷，谢升的影响力仍然显着，他参与了伪太子案的审理，判定所谓的前明太子实为冒名顶替之人。
顺治二年（1645年），谢升的生命走到了终点。正月十七日，他因病告假，清廷派遣太医为其诊治。两天后，谢升病逝。清廷对谢升的逝世表示了哀悼，追赠他为太傅，赐予“清义”的谥号，对其家属给予了优厚的抚恤，包括给予其子中书舍人的官职，以及丰厚的丧葬补助。然而，历史的评价并不总是如此宽