月，曹文诏整顿军队南下，并与洪承畴在信阳相会。洪承畴非常高兴，立即派遣曹文诏前往随州进攻农民军，曹文诏在随州追杀了农民军三百八十多人。四月，洪承畴驻扎在汝州，因为农民军全部转移到了关中地区，洪承畴决定回头先铲除农民军的老巢。为此，他分别命令各位将领把守要害，并发布檄文召曹文诏入关。曹文诏于是骑马到灵宝拜见洪承畴。
洪承畴分析认为农民军可能集中在商州和雒南两地，如果听说明军过去，一定会先逃往汉中。如果大军从潼关进入汉中，反而会落在农民军的后面。于是他命令曹文诏从阌乡取山路到商州和雒南，直捣农民军老巢，然后再从山阳、镇安、洵阳等地赶到汉中，阻止农民军逃跑。他对曹文诏说：“这次行军，道路迂回曲折，路程遥远，将军很辛苦，我将聚集关中的兵力等待将军的到来。”说完，他亲切地拍着曹文诏的背为他送行。曹文诏没有多言，即刻启程前往指定地点。
五月五日，曹文诏抵达商州。农民军距离商州城三十里，军营灯火遍布山野。曹文诏决定采取夜袭的方式，半夜时分率领侄子参将曹变蛟、守备官曹鼎蛟、都司白广恩等在深山老林中向农民军发动了突袭。在金岭川，农民军倚仗险要的地势，派出约一千名骑兵迎战。曹变蛟大声呼喊着冲入敌阵，各路兵马紧跟其后，农民军再次大败逃亡。曹变蛟勇猛无比，农民军中一听说“大、小曹将军”，都非常畏惧。
七、兵败自尽
不久之后，闯王高迎祥、八大王张献忠率领的各路农民军攻打凤翔，并向汧阳、陇州挺进，曹文诏从汉中紧急赶往前线。农民军此时都集中到了静宁、秦安、清水、秦州一带，兵力接近二十万人。
洪承畴考虑到曹文诏的兵力加上张全昌、张外嘉的兵力总共只有六千人，与农民军的实力相差悬殊，于是向朝廷告急，但未得到任何指示。六月，明军在乱马川同农民军遭遇。前锋中军刘弘烈被俘，不久副将艾万年、柳国镇又在战斗中阵亡。曹文诏听到这个消息后，愤怒地瞪大眼睛，立即前往洪承畴处请求出兵作战。洪承畴高兴地说：“除了你曹将军，没人能消灭这股农民军。但是我的兵力已经分派出去，无法再派出接应你的队伍。将军出发后，我会从泾阳赶到淳化做你的后盾。”
曹文