抚河南
顺治元年（1644年），随着清军入关，罗绣锦迎来了他职业生涯中的重要转折点之一。七月，清廷任命罗绣锦为右副都御史，并派他前往河南担任巡抚。此时，李自成的起义军正在西逃，其残部约有两万多人在卫辉、怀庆一带活动，进行劫掠。同时，原武、新乡等地也出现了许多小股盗匪，局势十分复杂。
罗绣锦抵达河南后，立刻与当地的总兵官祖可法等人商讨对策。他意识到，要稳定局势，必须先解决李自成残部的问题。于是，他向朝廷上疏报告了当地的情况：“李自成的残部大约有两万多人，正猛烈攻打怀庆。另外，前明朝尚书张缙彦等人在黄河附近集结兵力，而副将郭光辅、参将郝尚周拒绝接受调遣，反而转而成为盗贼。明朝的军队在南部，流寇则在西部，请求朝廷派遣军队前来平乱。”
清廷已经任命了豫亲王多铎为定国大将军，率领大军南下，计划途经河南，剿灭这些乱党。与此同时，罗绣锦也采取了行动，派遣卫辉参将赵士忠等人进攻娄儿寺盗匪的据点，并成功俘获了盗匪首领。
面对战后的重建问题，罗绣锦提出了一个重要的建议：利用河北地区大片荒芜的土地，让驻防的士兵进行屯垦。他认为这样不仅可以解决士兵们的粮食供应问题，还能有效利用土地资源，促进当地经济的恢复和发展。这一建议得到了朝廷的认可和支持。
三、总督湖广四川
顺治二年（1645年）十一月，罗绣锦被提拔为兵部右侍郎，并被任命为湖广、四川的总督。当时湖南的许多州县仍被南明政权的巡抚何腾蛟等人占据。李自成的侄子李锦及其残部刘二虎等人在投降南明后，开始侵扰湖北地区。罗绣锦到达荆州后不久，李锦就率军前来攻击。
面对李锦的进攻，罗绣锦组织抵抗。顺承郡王勒克德浑从江宁赶来支援，李锦战败后逃走。勒克德浑返回后不久，李锦再次卷土重来，罗绣锦亲自率军迎战，再次迫使李锦败退。此外，胡公绪占据天门的八百洲，并四处焚烧抢掠，杀害了代理盐道周世庆。罗绣锦派遣中军副将唐国臣和代理总兵杨文富等人分别出击，成功捕获胡公绪，摧毁了他们的据点。
顺治三年（1646年）六月，罗绣锦派遣总兵官徐勇攻打麻城的山寨，抓获了梅