九年起在巴东县建立了自己的基地。刘体纯初到巴东时，当地民众都躲藏起来，刘体纯派人招抚，使他们各自回归生产，供应租税。可以说，刘体纯是夔东抗清基地的主要创始人之一。
在刘体纯之后，大顺军余部如袁宗第、郝摇旗、李来亨、党守素、塔天宝、马腾云也先后来到了夔东地区，与从陕西汉中撤出的贺珍、在员阳起兵反清的王光兴、王光泰兄弟等组成了一个控制川鄂的抗清武装集团，通常被称为夔东十三家。据史籍记载，刘体纯被推举为夔东十三家的盟主，各部都遵循他的指挥。
在大顺军余部中，刘体纯与南明朝廷的关系相对疏远，基本上没有接受隆武或永历朝廷的直接调遣，而是独立作战。尽管如此，名义上他也接受了永历朝廷的封爵，永历改元时（清顺治四年，1647年）被封为平西侯，永历四年（1650年）晋封为皖国公。此后，由于孙可望掌控了永历朝廷的实际权力，大西军余部与大顺军余部几乎没有进行过有效的配合作战。顺治十四年（1657年）孙可望投降清朝后，李定国、刘文秀虽然有意改善双方的关系，但由于距离遥远，已经难以扭转颓势。
四、兵败牺牲
康熙元年（1662年），随着李定国的病逝，西南地区的抗清斗争遭遇了全面的失败。面对这一局势，清廷决定对夔东抗清武装展开大规模的三省会剿，由陕西、湖广、四川三个省份各抽调三万兵力，同时发起进攻。次年春夏之际，清军先后占领了袁宗第据守的大宁和郝摇旗据守的房县，迫使袁宗第和郝摇旗率领部队向巴东方向撤退，与刘体纯的部队会合。
为了打破清军的围剿，刘体纯、郝摇旗、袁宗第与以兴山为基地的李来亨部联合起来，决定对清军实行反击。七月，李来亨、刘体纯、郝摇旗等部农民军联手击败了湖广清军，湖广提督董学礼率领残兵败将逃回彝陵。取得东线反击战的胜利后，刘体纯、李来亨、郝摇旗、袁宗第、塔天宝、党守素、马腾云七部决定溯江西上，将四川总督李国英为首的清军包围在巫山县城。
经过十二天的激烈战斗，尽管农民军奋力抵抗，最终还是被四川官军击退。这年冬天，清廷派遣的西安驻防满洲兵到达巫山，穆里玛、图海所统率的京师八旗禁旅也进抵兴山附近。十二月二十三日