勘察河工情况，冀如锡归来报告称，不仅河道年久失修，而且缺乏有效的治河人才。当时的河道总督王光裕计划实施的几项工程，由于资金和粮食短缺大多未能启动，这表明他并不具备治河的能力。在这一背景下，康熙帝选择了靳辅作为新的河道总督。
在靳辅上任之前，清廷九卿会议就讨论过冀如锡等人提出的治河任务。根据他们的视察结果，急需修筑堤坝，其中包括黄河南岸从白洋河到云梯关、北岸从清河县到云梯关以及高家堰、周家桥、翟家坝、古沟等地的决口。此外，还需要加固其他溃坏和薄弱的堤防。需要疏浚的区域包括清口一带的沙淤及大运河受黄河水流淤淀的部分。最紧迫的任务是堵筑淮、扬两岸的堤坝、清水潭的决口以及归仁堤未完成的部分工程。
靳辅上任伊始，就有“八疏同日上之”的佳话，这足以体现他作为新任河道总督胸有成竹、雷厉风行的作风。这一事件发生在康熙十六年七月十九日（1677年8月17日）。从时间上看，靳辅三月得到任命，四月六日抵达宿迁上任（当时河道总督的驻地在山东济宁），随后开始了对河道的实地考察，历时两个月。能在一天之内连上八疏，完全是他亲自调查河道并认真进行研究的结果。在给康熙帝的奏疏中，他提到：“不论绅士兵民以及工匠夫役人等，凡有一言可取，一事可行者，臣莫不虚心采择，以期得当。”
不仅如此，靳辅从这次实际调查和访问中确定了他治河的总方针，即“审其全局，将河道运道为一体，彻首尾而合治之”。他认为，黄河河道的破坏程度不能仅用局部治理的方法来应对，而应当有一个全局观念，从整体上采取措施，将河道与运道合并起来共同治理。他强调治理黄河的重要性实际上关系到数省的安危，不能像过去那样只关注漕运的问题，而放任黄河任意冲刷。他的目标是确保“已淹之田可耕，见在之地可保，运道可通，额课可复”。
在治法上，靳辅并没有全盘否定前人的经验，而是结合实际情况采取灵活的措施。“有必当师古者，有必当酌今者；有须分别先后者，有须一时并举者”，因势利导，随时制宜。后来的事实证明，他主要采用了明代治河专家潘季驯的“束水攻沙”方法，而在“寓浚于筑”等方法上则进行了创新。
靳辅的总方针