对此表示关切，并回复说希望年年岁岁都能看到年羹尧呈上的平安报喜的消息。
胤禵离任后，青海地区的蒙古和硕特部酋长罗卜藏丹津开始蠢蠢欲动，意图反抗清朝统治。西北局势因此变得紧张，雍正帝决定继续用兵西北，旨在稳定边疆的同时，也希望通过一场胜利来巩固自己的权力基础。在当时西北有宗室延信和年羹尧两人坐镇的情况下，雍正帝选择了出身汉军旗的年羹尧挂帅。
雍正元年（1723年）五月，雍正帝下令将四川、陕西、甘肃、云南四省的一切事务交由年羹尧办理，显示了对年羹尧的信任和支持。不久之后，雍正帝又以延信驻扎甘州、指挥不便为由，免去了延信的西安将军职务，改命年羹尧继配夫人的叔叔、缺乏军事经验的宗室普照署理西安将军，实际上将西安八旗驻防军的指挥权也交给了年羹尧。
同年八月，罗卜藏丹津正式起兵反清，雍正帝命令年羹尧等人派兵接应被袭击的亲清王公，并派遣在西宁的侍郎常寿前往罗卜藏丹津军中宣谕，试图令其罢兵。然而，罗卜藏丹津已决心叛乱，不仅拘禁了常寿，还率领部队进攻西宁及周边地区。
面对这一紧急局势，雍正帝于同年十月正式任命年羹尧为抚远大将军，率领大军前往西宁进行救援，并与罗卜藏丹津作战。最初，战局对清军不利，年羹尧被困西宁，但他表现得镇定自若，率领少数士兵坐在城楼上，假装城中有大量援军。罗卜藏丹津误以为其中有诈，于是率军撤退。年羹尧随即指挥军队出击，罗卜藏丹津未料到年羹尧兵力如此之少，未能做好充分准备。在战斗中，年羹尧命令军队向桌子山藏族人开炮，造成了藏族人大量的伤亡。随着岳钟琪的部队到达，直接进攻敌营，罗卜藏丹津最终败逃，仅率少数人逃离战场。
在年羹尧困守西宁期间，国舅隆科多曾秘密向雍正帝建议，应该派人牵制年羹尧，以防他倒戈造反。然而，怡亲王允祥却持反对意见，认为既然已经将大军交给年羹尧指挥，那么再派人掣肘会影响军事行动的顺利进行。雍正帝最终采纳了允祥的意见，继续信任年羹尧。
年羹尧在岳钟琪的辅助下，逐步扭转了战场上的被动局面。雍正二年（1724年）二月，年羹尧终于击败了罗卜藏丹津的主力部队，平定了青海叛乱。捷报传到