在这个职位上的表现再次证明了他是一位具有卓越才能的学者和政治家。
嘉庆七年（1802年），当皇帝驾幸热河时，刘墉被留在京城主持朝政。此时的刘墉虽已年逾八旬，但依然精神矍铄，身体健康，眼睛明亮有神，显示出他非凡的生命活力。这种状态不仅让朝廷上下感到安心，也成为了后世传颂的佳话。
刘墉的生命旅程终于在嘉庆九年（1805年）画上了圆满的句号。十二月二十四日（也有说法是二十五日），刘墉在北京驴市胡同的家中安然离世，享年八十五岁。在他去世前两天，刘墉仍保持着积极的生活状态，不仅去南书房值班，还在夜晚邀请宾客共进晚餐，显示出他乐观豁达的人生态度。
据《啸亭杂录》记载，刘墉去世时，“鼻注下垂一寸有余”，这种现象在中国传统文化中被认为是吉祥的象征，暗示着刘墉一生功德圆满，得以善终。刘墉去世后，朝廷追赠他为太子太保，并赐予他“文清”的谥号，这是对他一生清廉为官、忠诚报国的高度评价。此外，刘墉还被允许入祀贤良祠，并由朝廷下令举行隆重的祭祀和葬礼仪式，以表彰他对国家的重大贡献。