保派遣精锐部队通过绳索攀爬进入寨内，并使用火药爆破战术，导致大量教匪坠崖身亡，山谷之中尸体遍布。
尽管如此，覃加耀仍然带着二百名残余势力逃往归州的终报寨。由于未能彻底消灭敌人，额勒登保受到朝廷的指责，被降为三等伯爵。不过，在嘉庆三年（1798年）春季，覃加耀最终被擒获，虽然因此次事件处理迟缓而被剥夺了爵位和官职，但他仍然获得了副都统的头衔，并被命令前往陕西协助镇压高均德、姚之富、齐王氏等人的叛乱。
在此期间，李全企图与这些叛军汇合，但被额勒登保击退。失去了李全的支持后，姚之富和齐王氏很快就被明亮和德楞泰击败。额勒登保继续追剿高均德，在两岔河地区发现敌踪，后者又分散逃往商州和镇安。
四月份，额勒登保前往荆州会合部队对付张汉潮，在竹山击败了对方，并紧追不舍，由陕西进入了四川。九月，他们在广元再次交手，并俘获了张汉潮的儿子张正漋。随后，额勒登保与德楞泰等人共同追剿川匪罗其清，后者据守营山箕山，但在德楞泰的攻击下被迫转移到大鹏寨。
额勒登保吸取了之前黄柏山和芭叶山战斗中的教训，决定采取速战速决的策略，亲自指挥部队在罗其清的防御工事前建立营地，并连续七天七夜持续进攻。最终，罗其清无法抵挡，逃向巴河附近的一个废弃堡垒。然而，就在即将取胜之际，额勒登保突然下令撤退，给敌人制造了一个逃脱的机会。但实际上，这是他精心策划的陷阱，利用教匪急于逃跑的心理，使其在逃亡过程中被民兵逐一捕获，从而实现了不战而屈人之兵的效果。这一策略的成功实施，不仅减少了己方伤亡，还迅速结束了战斗，额勒登保也因此恢复了他的荣誉标志——花翎。
三、四川剿匪
嘉庆四年（1799年），随着冷天禄、萧占国、张长庚等教匪的活动日益猖獗，朝廷决定加强在四川的剿匪力度。额勒登保在这场战役中扮演了至关重要的角色。三月份，他率领军队追击冷天禄至大竹，得知萧占国和张长庚已经从阆州逃往营山，立即调转方向，带领部队迎击。教匪占据黄土坪，背靠大山，面临长江，地势险要。额勒登保命令总兵朱射斗绕道鸡猴寨，切断教匪的西逃路线，自己则率领杨遇春从东面进攻城隍庙。教匪