咸丰六年（1856年），骆秉章继续指挥军队在外作战，取得了连克萍乡、万载等地的战绩。同年，清军计划分三路进攻江西，骆秉章的部队攻克了袁州、分宜、新喻等地。为了进一步增强军队实力，骆秉章下令曾国荃招募义勇军，以补充前线兵力。骆秉章的努力得到了清廷的认可，获赐花翎作为表彰。
到了咸丰七年（1857年），武汉被清军收复后，骆秉章关注到了湖南内部的问题，尤其是由于战争导致的漕运停滞和民生凋敝。他采取措施减轻百姓负担，减免了部分税收，以恢复当地经济。然而，这一年也是湘军在外作战的关键时期，骆秉章不得不继续调遣军队支援各地战斗，如在江西的恶战中，虽然王珍不幸战死，但他迅速安排了后续指挥，保持了军队的战斗力。
咸丰八年（1858年），骆秉章在朝廷的评价中获得了高度肯定，并因其功勋被授予头品顶戴。随着石达开的败退，江西地区逐渐稳定下来。骆秉章提出应乘胜追击的战略建议，并请求启用曾国藩领导救援浙江的行动，这表明了他不仅关注湖南的防御，还考虑到了整个南方的局势。
到了咸丰十年（1860年），骆秉章依然坚守在湖南，与太平军作战的同时，还向湖北、贵州、江西等省份派出援助。
四、督军入川
咸丰十年（1860年），太平天国运动仍在持续，而四川地区也出现了新的动乱。云南太平军李永和与蓝朝鼎兄弟率军进入四川，迅速控制了自贡盐场，并且部队人数迅速膨胀至十几万人。他们对川西和成都构成了严重威胁，使得清廷不得不紧急调派骆秉章入川督办军务。
骆秉章于咸丰十年（1860年）农历六月接受调令，此时他已经67岁高龄。面对着成都仅七十里之外的李、蓝太平军，骆秉章深知任务艰巨。四川本地的军队由于内部纷争和指挥不力，未能有效阻止太平军的推进。骆秉章带着湘军萧启江部一万二千余人进入四川，面对的是一支已经拥有庞大规模和强烈斗志的敌军。
骆秉章首先分析了敌情，发现李、蓝太平军采用“分兵略地”的战术，试图在四川各地建立根据地。基于此，骆秉章制定了集中兵力分别击破的策略，并运用反间计策来削弱敌人内部的团结。在战斗过程中，蓝朝鼎部