发动攻势，试图一举摧毁太平天国的中枢。然而，在陈玉成和李秀成等年轻将领的顽强抵抗下，太平军在接下来的几年里成功抵挡住了清军的多次进攻，使得天京暂时得以保全。
1859年，洪秀全的族弟洪仁玕抵达天京。洪仁玕曾在海外留学，熟悉西方文明，被洪秀全视为重振太平天国的重要人才。洪秀全高兴地封洪仁玕为军师、干王，并任命他总理天国朝政。然而，由于洪仁玕在当时并未立下显赫战功便获封王位，引起了其他将领的不满。为了平息众议，洪秀全开始分封其他异姓王，并逐渐开始滥封王爵，导致权力分散，进一步削弱了太平天国的凝聚力。
1861年，英国海军提督何伯与参赞巴夏礼访问天京，提出了以协助太平天国打败清政府为条件，要求事后平分中国领土。面对这一要求，洪秀全态度坚决，拒绝了英国人的提议，表明了他在维护国家主权方面的立场。然而，这一拒绝也意味着太平天国失去了可能获得的外部援助。英国人见无法从太平天国那里获得利益，转而支持清政府，使太平天国的处境更加艰难。
到了1862年，随着陈玉成的英勇就义，太平天国失去了另一位重要的军事领袖。与此同时，曾国荃率领的湘军再次逼近天京城外的雨花台，对南京城形成了严密的包围。随着天京城外的据点一个个落入清军之手，太平天国的形势急转直下。面对如此危急的局面，李秀成建议放弃天京，转战中原，以寻求新的生存空间。然而，洪秀全却拒绝了这一建议，坚持固守天京。
晚年的洪秀全思想趋于保守，越来越依赖宗教迷信。在天京面临重重危机之时，他并未采取有效的应对措施，反而向将士们宣称会有天兵下凡相助，驱赶清军。这种脱离实际的做法不仅未能提振士气，反而进一步加剧了太平军内部的悲观情绪。
六、因病逝世
到了1863年冬天，太平天国已经处于极其危险的境地。清军的围困使得天京城内的物资供应日益紧张，粮食匮乏，外援断绝。在这种情况下，李秀成多次建议洪秀全放弃天京，突围而出，寻找新的立足之地。然而，洪秀全拒绝了这一建议，他固守天京，寄希望于上帝能够降下奇迹，帮助太平天国击败清军。
洪秀全此时身体状况已经非常糟糕，他