清的部队，取得了七战七捷的辉煌战绩。这一系列胜利不仅稳固了广信的安全，也让沈葆桢的名字响彻官场。
1857年，沈葆桢因功被晋升为江西广饶九南道道员。同年三月，石达开再次率部攻打广信，面对强敌，沈葆桢与饶廷选指挥守军顽强抵抗，经过数日激战，终于迫使石达开撤兵。这些胜利进一步巩固了他的地位和声誉。
然而，到了1859年，由于父母身体状况不佳，沈葆桢请求暂时离任回家探亲。这次返乡不仅是对家人的思念之情得以缓解，也为长期处于高压状态下的他提供了宝贵的休息时间。两年后的1861年，随着曾国藩的赏识和支持，沈葆桢重新回到官场，先是被任命为吉赣南道道台，但他以父母年老需要照顾为由婉拒，转而在家乡负责地方团练事务。不久之后，曾国藩邀请他前往安庆大营担任要职，并很快推荐其出任江西巡抚，利用湘军力量继续对抗太平军。
1864年，随着太平天国首都天京（南京）的陷落，沈葆桢参与了追捕太平天国幼天王洪天贵福及其重要成员如洪仁玕等人的行动，最终将其捕获并处决，彻底平定了这场长达十余年的内乱。次年，即1865年，沈母去世，按照传统礼制，沈葆桢需辞官回家守孝三年
四、为政东南
同治五年（1866年）春，左宗棠升任闽浙总督，行辕设在福州。同年八月，清廷批准了左宗棠关于设立轮船制造局的奏折，决定在马尾江的三岐山下建设船政局，即后来着名的福州船政局。这一决策标志着中国近代造船工业的开端。然而，就在计划即将实施之际，左宗棠因陕西回民起义被调往陕甘担任总督。临行前，他力荐正在丁忧在家的江西巡抚沈葆桢接手船政事务，并亲自前往宫巷拜访沈葆桢，希望他能出山主持大局。尽管左宗棠两次探望，但沈葆桢均以“重孝在身”为由婉拒。
到了同治六年（1867年），朝廷最终还是决定任命沈葆桢接替左宗棠，出任福建船政大臣，全权负责福州船政局的建设和运营。此时正值洋务运动兴起时期，左宗棠在福州创办的造船厂尚未开工便离开了，因此沈葆桢上任后立即着手推进各项工作。他首先建立了船坞和机器厂，并附设艺童学堂，培养未来的造船技术人才。在他的领导下，福州船政局迅速发展