，但仍兼任户部尚书。这一年，德国借口山东曹州教案入侵胶州湾，翁同龢与张荫桓奉旨办理对德交涉。在与德国驻华公使海靖的多次交涉中，翁同龢坚持要求德国先撤军再谈判，并将教案与撤军分开处理。然而，德国方面并不接受这一方案，甚至以撤旗回国和开战相威胁。翁同龢对此感到非常愤怒，最终光绪帝劝他继续与海靖交涉，但他表示强烈反对，甚至在光绪帝面前表达了自己的不满情绪。尽管如此，他仍然未能改变局势。
光绪二十四年（1898年），詹事府右中允黄思永提议开办昭信股票，筹集对日偿款。翁同龢代表户部复议，并亲自拟定了股票章程，但最终筹集的资金远不及所需。同年正月十三日，光绪帝索阅黄遵宪的《日本国志》，翁同龢的回答未能满足光绪帝的要求。光绪帝还准备允许外国公使觐见时乘坐车辆进入禁门，翁同龢则认为不合礼仪，结果再次遭到光绪帝的批评。
二月十四日，翁同龢与李鸿章一起与德国签订《胶澳租借条约》。三月初三日，他参与了中俄关于旅大租借问题的交涉谈判，坚持删除俄方约稿中的一些不合理条款。面对各国企图瓜分中国的局面，翁同龢建议大开口岸，召开国际会议，确保各国不侵占中国领土，但这些建议并未被采纳。
三月初六日，翁同龢兼任吏部尚书。三月十三日，德国亨利亲王访华，光绪帝欲在毓庆宫接见，翁同龢以诸多不便为由反对，但未获采纳。四月十二日，御史杨深秀、内阁学士徐致靖上书请求诏定国是。四月二十三日，翁同龢奉命起草《定国是诏》，体现了他主张既要学习西方又要坚持传统儒家思想的观点。然而，四月二十四日，当光绪帝打算在宫内接见外国公使时，翁同龢再次表示反对，并遭到光绪帝的诘责。
最终，四月二十七日，光绪帝以翁同龢“近来办事多不允协，屡遭人参奏，且于召对时咨询事件任意可否，渐露揽权狂悖”为由，勒令他开缺回籍。
六、凄凉晚景
光绪二十四年（1898年）五月十三日，翁同龢离开了北京，回到了家乡常熟。当天，众多故旧门生如王文韶、廖寿恒、孙家鼐、盛昱、张謇等数百人前往马家铺车站为他送行。翁同龢在常熟居住了两个月，期间前往江西南昌探望翁同书的遗孀杨氏。然而，就在他