了分歧，守将吴建瀛与刘玉林之间产生了动摇，试图寻求和平解决之道。
刘铭传利用这一机会，一方面派遣部将前去说服刘玉林，另一方面则继续施压，与潘鼎新一同率军逼近南汇城。最终，刘玉林在内外压力之下，挟持着犹豫不决的吴建瀛出城投降。刘铭传利用乡情和利益诱惑，对吴建瀛的部队进行了整编，将其中的老弱兵员淘汰，收编了精锐力量，进一步壮大了自己的实力。
紧接着，在五月三十一日，刘铭传又率部击退了来自川沙方向的太平军进攻，并于次日乘胜追击，攻占了川沙。这一系列的胜利使得刘铭传声名鹊起，他因此升任游击，并被赏赐了象征荣誉的花翎。
三、连战连捷
在稳固了上海的局势之后，淮军按照上级命令开始向苏南推进，目的是削弱太平天国的势力范围。刘铭传与潘鼎新、张树珊等将领率领三千淮军，沿水路进攻福山。然而，在同观山与太平军遭遇时，淮军因轻敌而遭受挫败。幸得由外国雇佣军组成的洋枪队支援，最终夺下了福山。此役之后，刘铭传因表现突出，被授予“以总兵补用”的职位，并不久后担任江苏狼山镇守使。
随后，刘铭传率部继续推进，相继占领了太仓、昆山等地，并攻下了江阴县城。在这一系列的战斗中，刘铭传展现出了卓越的指挥才能，因此再次获得晋升，被任命为记名提督。到了同年十二月，刘铭传抓住时机，向无锡的太平军发起了进攻。经过一天的激烈巷战，刘铭传俘虏了守将黄子隆及其子黄德懋在内的两万多名太平军士兵。为此，清廷特赐刘铭传“加恩赏头品顶戴”。
进入1863年初，刘铭传奉命参与对常州的合围战役。在这场战役中，由于太平军的顽强抵抗，淮军遭遇了激烈的抵抗，经过四个多月的艰苦战斗，终于攻陷了常州。然而，在攻入常州城后，淮军对城内的太平军进行了大规模屠杀，包括护王陈坤书在内的近万名太平军将士丧生。刘铭传因功绩显着，被赐予“赏穿黄马褂”的殊荣。
攻克常州和苏州之后，淮军的实力得到了极大的增强，刘铭传的部队也迅速壮大，独立成军。他的部队分为左、中、右三军，每军六个营，再加上一个炮营、亲兵营及幕僚人员，总计约有九千人，配备了大量的洋枪，成为淮军中的主力之