回已聚集百余人队伍的刘邦，作为自己势力的支柱，如此则可以稳定局势。
待刘邦领军返回沛县之际，县令却反悔了。
他害怕刘邦反叛，便关闭城门阻止刘邦入城，并企图杀害萧何与曹参。
无奈之下，萧何与曹参只得翻墙逃出，归附于刘邦旗下。
两人合力刺杀了县令，夺得沛县控制权。
从此，萧何便担纲刘邦的内政粮草事务，制定法度，助力刘邦问鼎天下，立下了赫赫战功！
而刘邦，也由最初的沛公身份，逐步晋升为一方诸侯王！
然而，项羽忌惮刘邦，故设局将其封至偏远的巴蜀之地，并册立雍王章邯、翟王董翳、塞王司马欣三人，意欲包围监视刘邦。
此举令刘邦怒不可遏，欲与项羽决裂。
众弟子皆出言劝止，唯有萧何泰然自若：“前往汉中做诸侯王，岂不是比白白送死更为明智之举？”
刘邦心中仍有些不甘：“为何就一定是送死呢？”
“兵马不及他人，将领也不及他人，那还能算是什么？”
“此乃修行界的险恶之争，兵少将寡，便是以弱击强，逆流而上的挑战。”萧何沉声道。
萧何轻轻摇头，“此情此景，莫若暂且忍受屈辱，投身巴蜀之地，涵养元气，日后方能再谋天下霸业！”
刘邦闻此言方才如梦初醒，恭谨地领命前往汉中受封，并任命萧何为太玄真人，执掌内务仙政。然而，刘邦启程前往汉中之后，众多将领与弟子却不愿踏入那偏远的修炼之所，纷纷逃离，其中包括刚归顺不久的韩信。
对此，萧何并未多加挽留他人，但听闻韩信离去的消息，他毫不犹豫，即刻追踪而去。
终于，在月色之下寻回了韩信。萧何向韩信承诺，无论如何艰难，必将促使刘邦重用韩信。
韩信听罢，遂随萧何一同返回汉中修炼营地。刘邦得知陪伴自己多年、共图大道的萧何亦离开，犹如断了一臂，惶恐不安。在他心中，萧何不仅是自沛县起便追随他开疆拓土的功勋修士，更是负责内务仙政的首席真人！
萧何失踪两天后归来，刘邦又惊又喜，责问其离营原因。萧何淡然回应，自己并未离营，而是追韩信而去。