其实让兴献帝称宗入庙，最根本的目的就是摆脱朱厚熜以小宗入继大宗这个事实。小宗变大宗，难免有寄人篱下之感，因此嘉靖帝在登基之初，开始反对过继成为孝宗的儿子，在与百官三年的争斗中，总算实现追尊生父兴献王为“皇考恭穆献皇帝”，称呼孝宗为“皇伯父”，从法理上讲帝系传承彻底独立于孝宗一脉。
自己的父亲也成为皇帝，自己就不再是武宗皇帝绝嗣后，入继孝宗皇帝一脉的继子。而是兴献帝和孝宗皇帝之间兄终弟及的皇位传承，虽然此举有些掩耳盗铃之感，但是确实从礼法上挑不出任何毛病，孝宗和兴献帝乃是亲兄弟，他们之间和皇位传承是帝系发生了转移。
由孝宗一脉到兴献帝一脉，他们都是宪宗皇帝皇子，礼法上可比朱厚熜以堂弟的身份继承武宗皇帝的皇位要硬气的多，谥法可不仅仅只是死人用的，它更是给活人看的，用以传示后代，是尊显政治地位的一种工具。
朱厚熜此举就是要将自己一脉的地位与孝宗一脉拉平，这样自己的子孙才能够堂堂正正的坐稳皇位。可是天下又有几人能明白他的苦心呢？
朱厚熜心里想，杨廷和这个老匹夫肯定是明白的，可惜他没看到这天。现在兴献帝神主未入太庙，从礼法上说还是要矮其他帝王一头，这是嘉靖不能容忍的。只要完成了这一步，就算功德圆满了。一想到这里，他就充满了斗志，当年大礼议都扛过来了，现在这帮小鱼小虾算什么，放马过来啊！