李默的下狱虽然在朝廷中引起了波澜，但是对于不少官员来说，这件事情并不意外，李默长期和严嵩对着干，严嵩早就想收拾他了，只是苦于没有找到借口罢了。
这次被赵文华弹劾，也只能怪李默自己不谨慎，为人所乘。严党觊觎吏部尚书的位置已经很久了，这次终于得偿心愿，李默下狱后，嘉靖令内阁学士吕本掌吏部，暂摄部事。同时三法司、科道和礼部一起详议礼部的罪名。
当然，眼下最重要的事情还是北虏的入寇，朝廷要宣大、蓟辽等镇加强戒备，当然离不开钱粮了。首先就是东南的备倭，眼下朝廷专注于北虏，东南就更加不能出事，经过户部、兵部的商议，上报内阁后，嘉靖下诏，留两淮余盐银之半于直浙备海防军兴费用，要求南直隶巡抚唐顺之和浙江巡抚胡宗宪严加防备，不得令倭寇袭扰。
接下来就是整顿宣大和蓟辽两镇了，首先是发太仆寺发马价银一万二千两送真定军门买壮马一千匹，分给保定奇正营、定州河间游兵营，加强蓟镇的骑兵。
同时升山西按察使马九德为都察院右佥都御史整饬蓟州边备兼巡抚顺天，为了防止再出现庚戌之变时京师疲弱的情况，经过廷推，升南京吏部尚书郑晓为都察院右都御史兼兵部右侍郎协理戎政，整饬京营。
同时开始大修边墙，发宣府镇修边银三万五百余两修筑五路墩台，发太仓银三万一千七十余两于延绥，三万两于山西充饷，再调动河南、山东两都司客兵于良乡等处待命，发太仓银二万两充良乡涿州客兵饷。
又因为蓟辽总督欧阳必进上疏称紫荆关防守薄弱，要求加固边墙，嘉靖这个时候也不再小气了，发太仓银一万八百两于紫荆关为修边费。
为了加强蓟镇，在内阁和户部、兵部商议之后，发官军月粮银九千两兼本镇修边募军余银一万八百四十两修紫荆马水倒马等关隘，发太仓银二万两于蓟镇充客兵军饷，再发太仓银六万四千八百八十六两有奇，于宣府镇为新召义勇及守墩官军军饷。
朝廷四处筹措军饷，修整边墙和征调客兵，就是为了加强蓟镇的防御。但是没想到蒙古人却先发制人，嘉靖三十五年九月，北虏两万骑，入寇辽东平川锦川等堡，辽东官军大败。
九月也是朱载坖和王直约定的交货时