游途中病死在沙丘（有趣的是战国时期的赵武灵王也是因为继承人问题没解决最后被政变逼死在沙丘，活活被饿死）。据说秦始皇在临死前曾有遗诏命扶苏继承皇位，可他身边的宦官赵高联合丞相李斯以及秦始皇的小儿子胡亥篡改了遗诏，并且伪造遗诏让扶苏和大将蒙恬自裁，让胡亥继承皇位。
为了达到他们的目的，赵高他们秘不发丧，装作秦始皇仍然活着，宣布继续巡游。当时天很热，秦始皇的尸体开始腐烂发臭，为了掩盖臭味，赵高下令在秦始皇的车上装了很多臭鲍鱼以此掩盖尸臭。千古一帝秦始皇帝最终落得死后和臭鲍鱼为伍的下场！
等传来了扶苏和蒙恬自裁的消息后，李斯等人终于下令返回咸阳，然后宣布秦始皇死亡的消息，拥立扶苏继承皇位，是为秦二世。
三年后，秦朝灭亡，秦始皇生前期冀“万世一系”的大秦帝国最终“二世而斩”。其很大因素在于秦始皇继承人问题没有解决好，当然，秦朝灭亡还有其他原因，我们这里就不展开了。