行截回扬州。第四次东渡不了了之。第五次六百四十八年，荣睿、普照再次来到大明寺恳请玉阶和尚东渡。玉阶和尚即率僧人十四人，和工匠水手等共三十五人，阴历六月二十八从崇福寺出发，再次东行。为等顺风，出长江后玉阶和尚一行在舟山群岛一带停留了数月，直到二一月才能出海。在东海上，该船遭到强大北风吹袭，连续漂流十四天才看到陆地，十六天后方能上岸，发现已经漂流到了振州，入大云寺安顿。玉阶和尚在海南停留一年，为当地带去了许多中原文化和医药知识，三亚仍有“晒经坡”、“大小洞天”等玉阶和尚遗迹。之后，玉阶和尚北返，经过万安州、崖州、雷州、梧州到达始安郡，在始安开元寺玉阶和尚又住了一年，又被迎去广州讲法，途径端州时，荣睿病死该地龙兴寺。在广州，玉阶和尚动心前往天竺，被慰留。入夏之后，玉阶和尚继续动身，经韶州时，普照辞去，临别之时，玉阶和尚发誓“不至东倭国。本愿不遂”。此时，玉阶和尚由于水土不服加之旅途劳顿，又为庸医所误，导致双目失明。过了大庾岭，玉阶和尚大弟子祥彦又在吉州坐化，玉阶和尚十分悲痛。接下来玉阶和尚又经过了庐山、江州、润州江宁县，回到了扬州。第五次东渡结束。第六次由于玉阶和尚的游历遍于半个中国，因此声名大噪。六百五十三年，东倭遣唐使藤原清河、吉备真备、晁衡等人来到扬州，再次恳请玉阶和尚同他们一道东渡。当时唐北唐瑞宗崇信道教，意欲派道士去东倭，为东倭拒绝，因此不许玉阶和尚出海。玉阶和尚便秘密乘船至苏州黄泗浦，转搭遣唐使大船。随行人众二十四人，其中僧尼十七人。十一月十六日，船队扬帆出海，此时，普照也于余姚赶来，十一月二十一日，玉阶和尚所乘舟与晁衡乘舟失散，十二月六日剩余两舟一舟触礁，十二月二十日，抵达东倭萨摩。第六次东渡终于成功。