马腾在槐里十余年间“北备胡寇，东备白骑，待贤进士，衿救民命”，使三辅一带在战乱中免受一了段时间的战争骚扰，得到了十年的安定。三辅一带的人民对马腾相当爱戴。“三辅皆安爱之“，后来，马腾“自见年老，引入宿卫”，曹操在发动南征之前，将西部有威胁的马腾招入京做官，官封卫尉，应该是掌管京城（当时的许昌）的宫门的职务，但是，全家却被曹操移到了邺城去，软禁了起来。马腾入朝为官，把部队交予儿子马超管理，曹操南征失利后，听说刘备向西发展，于是准备进攻西部，就想先箭除马超等关西势力，让西部巩固后再进攻汉中等地。于是先将马超逼反，然后师出有名，在渭水与潼关交界处与马超等关西联军展开会战，通过六个月的战斗，最终采用贾诩的离间计将联军打败，马超、韩遂等势力基本上瓦解，第二年，曹操将已经被囚禁下狱的马腾一家百余口人杀害，后来马超为父报仇而投降刘备并引刘备重新夺回了汉中。
马腾墓位于河南许昌市北10公里的苏桥乡冢许村，占地半亩，冢高两丈余，数株翠柏环生其上，马腾及其家属因受到株连被杀，葬于石梁河畔。戏说三国志演义的时代小说《反三国演义》中，说他有叫作马云绿（马云禄）的女儿，纯属虚构。