军平叛，马忠不负使命，击杀刘胄，平定叛乱。蜀汉朝廷加封马忠为监军奋威将军，并封为博阳亭侯，讨平刘胄后不久，牂牁郡、兴古郡的獠人又起兵作乱，马忠令张嶷前往讨伐，招降其众两千余人，送往汉中用以充实蜀汉的北伐军队。
马忠成为庲降都督后，将治所迁到了建宁郡味县，处于汉族和夷族之间，加强对夷人的管理。越巂郡自从建兴三年诸葛亮讨平高定叛乱之后，叟夷部落数次作乱，先后杀死太守龚禄、焦璜，从此以后越巂太守都不敢去郡里上任，只敢驻扎离越巂郡郡治邛都八百里的安上县，故越巂郡徒有其名。马忠在越巂太守张嶷的辅助下，恩威并济，剿平乱夷，迁回郡治，修缮城郭，控制盐铁资源，并重新贯通越巂郡到成都的道路，恢复亭驿通信，使越巂郡重现旧时的秩序，因此功劳马忠被加封为安南将军，并进封彭乡侯。
诸葛亮时代，马忠先后以出众的个人能力，担任过丞相府参军和长史、益州治中从事等要职。马忠这个人，大多数人可能并不熟悉，但恰恰是这个人，在蜀汉集团后期，却扮演了一个极其重要的角色。
延熙五年，这一年发生了一件极其敏感，但却容易让人忽略的事情：庲降都督马忠回朝。马忠手握重权于外，如今突然入朝，自然会引起蒋琬、费祎、姜维这些既是诸葛亮嫡系，又是现任执政者的密切注意。最重要的是蒋琬必须率军自汉中回撤到涪县的原因，是马忠入朝的背后，隐约有着蜀主刘禅的影子。
自延熙年间开始，刘禅开始逐渐告别诸葛亮时代的乖乖形象，转而极力谋求亲政，诸葛亮在世之日，刘禅老老实实地为刘备守了整整三年的孝，诸葛亮一死，刘禅“四时之祀，或有不临”，连例行公事的对天地祖宗，按时祭祀活动也懒得参加了，这也可见刘禅已经获得了很大的自由空间。对刘禅这种“数典忘祖”的悖逆之举，蒋琬等人拿他毫无办法，而且刘禅还开始耍起了政治手腕，开始玩弄权术。蒋琬最初以尚书令身份总揽政事，而刘禅却连续升任他为大将军、大司马，相应地，刘禅又令费祎顶替蒋琬留下的缺空，费祎一路升至尚书令、大将军。
众所周知，大司马之职和大将军之职，其实是并列和重叠的，大司马就是大将军，大将军就是大司马，两者品级相同、权限相同、职责相同，仅