岭南地方势力反抗的过程中积蓄自身实力，一面努力寻求剪灭岭南割据势力的机会。
任交趾太守40年之久的士燮去世，士燮的儿子士徽意欲叛吴自立，割据一方，孙权出于防范，欲罢免士徽交趾太守一职，改任其为安远将军，领九真太守，以校尉陈时接代士燮为交趾太守，目的是进一步削弱士徽的势力，对此，士徽更加不满，叛吴之心益明。为此，吕岱上表孙权建议分拆南海三郡设置交州，以将军戴良为交州刺史，海东四郡另外虚置广州，吕岱自任为广州刺史。孙权采纳了吕岱的建议，派遣戴良与陈时南往就任，士徽不服从命令，公然发兵防守海口以抵拒戴良等人，吕岱知道士徽此时不除，必然后患无穷，一面上书孙权请求征讨士徽抗命之罪，一面书致士徽“告喻祸福”，发动政治攻势。
同时，吕岱亲率三千铁骑随即从南海出发，昼夜兼程赶至交趾。士徽听说吕岱大军已兵临城下，大为震惊，在走投无路之际，只好与其兄士祗、弟士干、士颂等6人“肉袒迎岱”。吕岱接着乘胜进军讨伐九真，大军所到之处，无不望风披靡，自此岭南才算真正纳入东吴政权直接控制之下。吕岱因功被封番禺侯，升为镇南将军。后来，孙权又将岭南七郡合并为交州，仍令其为交州刺史。
任交州刺史期间，吕岱再次显示出他过人的才干，多次派官员“南宣国化”，出使“西南大海洲上”以及今东南亚一带众多国家，境外扶南、林邑等国国王纷纷派遣使者至吴朝贡，吕岱的这一举措，在我国历史上可与东汉时期班超遣使，访问西亚各国一事相媲美。范文澜在《中国通史简编》中指出：吕岱这次外交行动“从此开始了中国和海南诸国的正式往来……”东吴政权恢复对岭南的实际统治，是中央政权对于地方割据分裂势力的胜利，吕岱功不可没，其功不在周瑜、鲁肃之下。
南方平定后，吕岱被召回驻守长沙，79岁的吕岱奉命屯军薄圻，与陆逊共同镇守武昌，负责京师防务。吕岱身为年高德昭老将，凡事均以国事为重，与陆逊精诚合作，恪尽职守，做事奋勇争先，论功劳则主动退让。在荆州时，吕岱同时兼掌荆州文书，军政公务极为忙碌，尽管已年过八旬，但仍保持“躬亲王事”作风，亲自处理公文，精力过人的他不知疲倦，骑马总是一跃而上，吕岱如此老当益壮