座下猛将如云，竟还有朱文正此等军事奇才，若能效力于我，势必如虎添翼！”最终朱元璋准备好了一切，统率40万大军，千帆竞扬，向洪都浩浩荡荡地开来，吴军与汉军在翻阳湖大战，结果陈友凉战亡，全军覆没。洪都保卫战取得了最终的胜利，这场战役，决定了朱元璋的霸王事业，改变了元末明初整个局势，朱文正可谓居功其伟。
正是因为这场长达三个月的洪都保卫战，朱文正充分发挥了不逊于同时代任何名将的军事天赋和指挥才能，造就了朱文正人生的巅峰。朱元璋打败陈友谅后，他论功行赏，由于朱文正是他的侄子，立功最大，所以他先问朱文正有什么要求，要封什么官。朱文正颇有些大将风度，对朱元璋说，咱俩是亲戚啊，你先封别人吧，我对这些没什么兴趣，朱元璋听了大喜过望，觉得自己的这个侄子真是个人才，识大体，顾大局。于是就把好的位置封给了别人，仍旧让朱文正来守江西，他哪里知道，朱文正是跟他客气客气的，守洪都是我功劳最大，论功行赏却没有我，他怎么想也想不通，整日借酒浇愁，还公然出外强抢民女，卖官赚钱。但这仍然不能让他达到心理平衡，每当他看到那些手下在应天这些富庶的地方耀武扬威，而自己只能守着江西，都会从心底里对朱元璋表示不满，当这种不满到达顶点，他就必然走向极端，天下谁还可以和朱元璋抗衡？只有张士诚了。然而朱元璋先发制人，朱元璋本来想处死朱文正，但由于马皇后的劝阻，他没有这样做，而是将朱文正在桐城软禁起来，终老囚中。
但朱文正所立下的赫赫战功朱元璋也没有忘记，据《明实录》的记载，文正死后，朱元璋就把朱文正年仅八岁的儿子，封为靖江王并接到宫中抚养，而且对他严加管教，朱元璋曾一度教训道：“你爸爸屡教不改，忘记了咱家过去的艰难困苦，以至恣肆凶恶，成了爷爷我的一大心病，你小子长大以后，爷爷我还是会封爵于你，并不因为你爸爸的过失而牵连于你，但是你小子要修德励行，不要重蹈你爸爸的覆辙，更不要辜负爷爷我的期望啊！”朱文正年仅八岁的儿子就藩桂林，并传了14代，相袭280年，成为明史上唯一一脉非太祖血统的王族。
这个战功卓着，颇具天才的将领就这么结束了他的光辉一生，最后在囚禁中死去，他的悲剧源自于他的性