却实实在在地被孙子牵连上了，并被逮至京师，以便“明正典刑”，幸亏“皇后太子力救”，朱元璋才算是“法外开恩”，饶了他一条老命，将他流放至四川茂州。皇太子朱标是如何营救老师宋濂的，《明史》上没有具体记述，只在《后妃传》中记载了马皇后营救宋濂的经过：当宋濂被逮至京师，即将处死时，马皇后劝谏道：“普通百姓为子弟延请老师，尚且要有始有终地待之以礼，何况天子呢？再说宋先生远在老家浙江，对孙子的所作所为一定不知情。”朱元璋根本不听。马皇后非常伤心，在侍候朱元璋用膳时，她一改往日的习惯，既不吃一块肉，也不饮一滴酒。朱元璋奇怪地询问缘故，马皇后答道：“宋先生快要死了，妾在为他作福事啊。”朱元璋终于动了恻隐之心，投箸而起，第二天就赦了宋濂的死罪，改为流放茂州。
在明人徐贞卿所着的《翦胜野闻》中，不但详细记载了太子朱标与马皇后营救宋濂的经过，而且根本不提胡惟庸一案，似乎要向人们表明：宋濂之罹祸，根本与胡案无关；或者说硬牵上胡案，只是要搞掉宋濂的借口罢了。徐贞卿没有明确记载宋濂的死因，其余野史、地方志、碑铭墓志中却多有记载宋濂是绝食或自缢而死的。即使如《明史》、《明实录》所载，是病死，那么，一个七十多岁的老人，目睹着家被抄，儿、孙被杀，自己也被押赴崎岖蜀道充军，而且这一切还是来自于自己为之服务、效忠多年的王朝与皇帝，更何况自己不但有德有才有功勋，而且谨小慎微，从未居功自傲，竟仍然难逃大劫，他能不病么？他能不气病而死么！
宋濂一生着述繁富，除主持纂修了二百十二卷的《元史》外，仅见之于《明史·艺文志》的就有《孝经新说》、《孝慈录》、《唐仲友补传》、《浦江人物记》、《燕书》、《萝山杂言》、《心经文句》、《潜溪文集》、《銮坡前集》、《銮坡后集》、《銮坡续集》、《銮坡别集》、《芝园前集》、《芝园后集》、《芝园别集》、《朝天集》等。吴晗先生在《朱元璋传》中说：“朱元璋用严刑重罚，杀了十几万人，杀的人主要是国公、列侯、大将；宰相、部院大臣、诸司官吏、州县胥役；进士、监生、经生、儒士、文人、学者；僧、道；富人、地主等……”处于这种大气候之下，身为“开国文臣之首”的硕学鸿儒，纵然战战