但以自己的谋略使燕王最后下了决心，而且要作各方面细致的准备，其中的练兵和铸造兵器尤为重要。
燕王领兵在外，北平只有少量兵力，由姚广孝负责守城，面对强敌，姚广孝临危不惧，多次打退李景隆的进攻。他知道苦守孤城，势不能久，必须以攻为守，才能保住北平，于是，他乘李景隆久围松懈之际，夜间突然命军士杀出城门，出其不意，杀得明军自相践踏，死伤无数。燕王攻拔大宁后，回师北平，内外夹击，将包围北平的李景隆军打得大败而逃。姚广孝对保卫北平，保全燕王的创业基地做出了重要贡献，而且大大削弱了朝廷的军事实力。燕王起兵三年，与朝廷各有胜负，但没有突破性进展，仅仅保住了北平、保定、永平三府而已。
燕王和姚广孝敏锐地意识到，长此下去，别说夺取朝廷政权，就是生死存亡都很难预料。在这危急的关头，姚广孝不愧为一个出色的谋略家和军事家，他在总结了三年的作战得失后，提出了令人难以想象的奇谋，这就是：“毋下城邑，疾趋京师。京师单弱，势必举。”这一奇谋的提出，燕王没有想到，建文帝更没有想到。谁敢出这样的计谋啊？谁能想出这样的神机妙算啊？燕王高兴地说：“频年用兵，何时已乎，要当临江一决，不复返顾矣。”而燕王按照姚广孝的谋略，甩掉了朝廷部署在北方的重兵，在其兵力薄弱的地带穿插突进，竟然在短短四五个月中攻到长江北岸，与京师仅有一江之隔。
至此，建文帝惊恐失措，无计可施，只得请求割地求和。燕王已稳操胜券，攻取京师只在旦夕，因而对建文帝的求和置之不理。朱棣挥师自瓜州渡长江，建文帝派兵迎战，均告失败。燕军兵临城下，建文帝政权岌岌可危，谷王朱橞、大将李景隆等开城投降，京师遂告陷落。宫中火起，建文帝不知所终。燕王朱棣进入京师，终于夺取了明朝的政权，当了皇帝，他就是赫赫有名的明成祖，定年号为永乐。
当朱棣得了天下之后，姚广孝却学起来张良，选择半退隐，继续做一个和尚，为了报答姚广孝的功劳，成祖让姚广孝蓄发，姚广孝不肯；成祖又赐给他府第和两名宫女，姚广孝也不肯接受，仍然住在寺院。在朝堂上，他的衣着和身份，不仅在当时独一无二，而且在历史上也是少有的，姚广孝以钦差身份前往苏湖赈济，这是