，回乡守丧，服丧期满，改调陕西布政司右参政。固原盗乱爆发后，朝廷派军征讨满四，朱英负责调运粮饷，立下功劳。升福建右布政使，迁陕西左布政使，他在两地都推行均徭法。以都察院右副都御史职巡抚甘肃，他先后陈述安定边防二十八件事，其中请求迁徙定居的少数民族，安置流转、离散人员，减少进贡使臣人数，这些都十分切中时务。
两广总督吴琛去世，朱英因之前在广东颇有威信，被朝臣举荐为总督两广军务兼理巡抚，自从韩雍在大藤峡之战取胜后，将帅喜好邀功，以俘掠为利，称为“雕剿”。朱英到任后，以安定清静为原则，约束告诫将士，不得为叛乱者夸大声势，胡乱出兵。他招抚瑶族、僮族归顺者，定为编户，免除三年徭役，马平、阳朔、苍梧诸县的少数民族因而望风归附。而且荔波叛军李公主有数万人马，长期凭恃地势险固，至此也派其子为质，以表归顺之意，朱英将他们安置在永安州居住，使他的子孙世代担任吏目。以此归附的少数民族日益增多，有四万三千多户，总计十五万多人，宪宗十分赞赏。
平乡伯陈政因自己为世袭勋臣，而想位居朱英之上，朱英不答应，奏请朝廷裁定，朝廷下令解除朱英总督职务，以巡抚职，居于陈政之下。兵部尚书余子俊认为朱英招之来归附者众多，本应当增加俸禄给予奖赏，却反而削减其权力，只怕无法控制各少数民族，宪宗于是升朱英为右都御史，仍任总督，坐次如前。
田州酋长黄明奸淫知府岑溥的祖母，并企图杀害岑溥，岑溥逃到思恩，黄明于是大肆屠杀，朱英率军征讨，传檄岑溥的族人、思恩城知州岑钦杀黄明雪耻，岑钦于是诛杀黄明及其族属，将其首级挂在军营之门示众。
朱英质朴、敦厚，然而执法从不宽容，他与管理市舶贸易的太监韦眷相抵触，韦眷弹劾朱英专权轻视贼人。浔州知府史芳因犯事曾被朱英责备，他也在弹劾中诬陷朱英奸诈、贪婪、欺骗蒙蔽，朝廷经过调查发现二人的弹劾都无证据，就将史芳降官二级，并告诫韦眷与朱英融洽共事。
交趾进攻老挝，朝臣担心交趾会借机入侵，宪宗问朱英询问处置方法，朱英回答说：“那不过是为争边界而已，警告他们，他们就一定会恐惧、改悔。”宪宗接受朱英的意见，交趾果然上表致歉。同年，浔州、