京囚犯，朱仪等建议：“南京今年遭遇大旱，颗粒无收，来年春季的米价定将飞涨。请求令南京各卫所的官军，在来年春时浙江等布政司及直隶的苏、松诸府运粮运抵的当天，免去他们搬运、筛晒的费用，直接在码头支给正粮。三月间省下的耗米，令官军送交应天府的预备仓，以备青黄不接时平价卖出，以缓解民困。所卖的钱银，待秋收后买米入仓。”户部覆议，认为此事“果于军民有益，即听施行”，宪宗允准。
朱仪自称多病，请求回京调治，宪宗认为他堪负重责，不允辞官，加官太子太傅。朱仪逝世，享年七十岁，孝宗闻讣讯，为之辍朝一日，加赐其家米、布，命有司负责丧葬事宜，“赐祭者十三”，皇太子朱厚照及诸王亦皆致祭，其后又追赠他为特进光禄大夫、右柱国、太师，赐谥号“庄简”。朱仪死后，南京军民巷哭相望，葬于昌平北泽山二王墓。
朱仪在南京三十四年，整顿漕运，赈济灾民，颇有治绩，朱仪在逝世后，由其女婿、魏国公徐俌接任职位，成为明代“妇翁与婿同在大位”的一桩盛事。临终时抓着长子朱辅的手，比画“将士”二字，以忠义相勉励，朱辅袭封成国公后，恭谨儒素，不负父望。