向嘉靖皇帝建议说：“山陵事体重大，太祖欲迁仁祖于钟山，就是担心泄漏了灵气才没有实行，这些事在《皇陵碑》上写得清清楚楚，所以要慎重”。他的一番话让嘉靖皇帝取消了迁移钟祥显陵的计划，他兴利除弊不遗余力，如武宗后期所形成的侈汰风气，造成库藏殚虚。孙交采取裁减中官冗员，除去经制宿弊等办法，使国力逐渐恢复。如正德中，上林苑内臣至99人，侵夺公私地不计其数。嘉靖皇帝即位后命留18人，但不久又复传奉至62人，孙交乞汰如初，且侵夺地尽数归还。御马监阎洪请给外豹房地，孙交说：“先帝以豹房故，贻祸无穷。阎洪等欲修复以开游猎之端，非臣等所敢闻”，在他的坚持下只颁诏以地十顷给豹房，余令百户赵恺等佃种如故。他还奏疏认为各处巡抚官每岁入京议事不便，除漕运总兵、参将八月会议运事外，其余应议重大事止令奏请等等。这些建议，嘉靖皇帝基本上都予以采纳，使朝政振兴，面目一新，因而得到了朝野的许多好评。
特别值得一提的是，在任期间孙交曾有“安陆乃发迹旧都，民贫役重，每岁有起运钱粮，乞改为存留，以培根本”的奏本，获嘉靖皇帝准许，这是孙交为家乡人民所做的最大一件好事。孙交言论谦恭谨慎，从不以势位骄人，因而在朝中颇有人缘，给事中夏言等清核皇庄田，极言皇庄为害于民，在孙交的努力下，使正德以来投献侵牟之地，大多逐渐退还于民，宦戚辈虽从中阻扰，而朝野投以赞许，因此有许多拥护他的朋友。
世讲之好，谓两姓子孙世世有共同讲学的情谊，后称朋友的后辈为世讲。明人称孙交与李东阳为湖广同乡相厚，又与杨廷和之父杨春同中辛丑科进士，有世讲之好。有一次，孙交奉诏上各官庄田数，因为视旧籍有所不同，嘉靖皇帝责问其原因。户部主事林应骢主动承担责任“部疏，臣司检视，即有误，当罪臣，尚书总领部事，安能遍阅？今旬日间，户、工二部尚书相继令对状，非尊贤优老之意”。最后还是孙交出面解释才化解了皇帝心中的疑问，他从容不迫地说：“旧籍多是因为奏请投献，数多有妄报也，新籍少是因为奉命清核，田多除豁也”。显然这是孙交认真调查的结果，因为“帝意稍解”，也让那位“妄言奏扰”的户部主事只受到夺俸两月的处罚。
孙交还有一个部下叫杨淮