叛匪用巨大的树木砍下阻塞关隘入口，在地下布满了蒺藜，埋伏起来射出毒镖，并且把石块放在树上，遇到紧急情况就撼动大树，石块全都会掉下来，明军破解了叛匪的这些计策。右军延误了日程，导致田州的土酋卢受放了叛匪离开。在此战中俘获叛匪四百五十人，招降的人有二千九百多人，当地的土人说，祖祖辈辈在这里居住已经八世了，从来没听说官军有到这里剿匪的，向朝廷奏捷之后，张经被进为左侍郎，加秩一级。
在镇压了两广的瑶族叛匪之后不久，安南国相莫登庸杀其王自立，致使内乱不息，长期不向明政府进贡，且又侵占明朝边境土地。明政府决定兴师问罪，派原总督宣大、山西军务的毛伯温到广西，与张经会商进兵。廉州知府张岳和广西副使翁万达相继进言，认为安南正忙于战事，没有工夫前来请贡，并不是有意怠慢明朝上国的。况且远征安南劳师糜饷，这不是一条上策，应该想法子震慑他们让他们不敢不听从号令。张经和毛伯温采纳他们的建议，一面用重兵压境威慑，一面派张岳入安南，晓以利害。最终，莫登庸权衡利害关系，向明朝谢罪，避免了一场战祸。
副使张瑶等讨伐马平瑶族的叛乱屡屡失败，于是嘉靖帝怪罪张瑶而起用张经，给事中周怡弹劾张经，张经于是乞求免职，嘉靖帝不准许。后来因为丁忧而罢官归乡，丁忧完成之后起用他为三边总督，给事中刘起宗上书弹劾张经在两广的时候参见克扣官兵的饷银，所以明廷取消了之前的任命。
朝议以倭寇猖獗，应要设总督大臣，命张经解除之前的职务，总督江南、江北、浙江、山东、福建、湖广各省的兵马，便宜行事。于是，张经征召了两广的狼土兵为之听用。初到任时，因各将位崇气骄，与倭寇作战屡次失败，世宗下令罢免屠大山应天巡抚职，张经因负连带责任，改为右都御史兼兵部右侍郎，代替屠大山负责当地防务。当时，倭寇两万多人盘踞浙江柘林川沙堡，且人数愈聚愈多，张经每日选将练兵，准备等俍兵齐集，一举尽歼倭寇。
倭寇进犯乍浦、海宁，攻破崇德，转掠浙西，江南百姓长期受倭寇侵犯，纷纷责怪张经按兵不动，纵容倭寇，世宗闻知，大为恼怒，限期要张经进剿。这时，权相严嵩的干儿子、兵部侍郎赵文华巡海督师到浙江，催促张经进兵。赵文华自