卜失兔纠集各部深入到定边，在张春井扎营，麻贵乘敌人内部空虚，直捣河套敌人营帐，斩首二百五十多级。麻贵从宁塞回兵，又迎击的卜失兔部落的零散骑兵，适逢敌军久留内地，辗转掠夺直到下马关。宁夏总兵萧如薰抵挡不住，总督叶梦熊火速传令麻贵前往增援，麻贵率副将萧如兰等人连战日丽马台、薛家洼，大胜，万历帝为此祭告祖庙宣扬大捷，提升麻贵署都督同知，给予世代荫封。
卜失兔又犯边塞，抢掠了八天后才回兵，顺义王撦力克与他相约求和，卜失兔不听，又准备大举入边。麻贵统兵一万五千人，游击阎逢时等出红山为中军，参将师以律等出高家堡、神木、孤山为左军，参将孙朝梁等出定边、安边、平山为右军，而自己率领大军独当一面。衔杖急进，出塞六十里，敌人不知道防范，大败，后麻贵因病归乡。
明朝、日本和谈失败，朝廷起用麻贵为备倭总兵官，奔赴朝鲜，加封为提督，统领南北各军。麻贵快马赶到王京，倭寇已经进入庆州，占据闲山岛，包围南原。守将杨元逃跑，全州守将陈愚衷也逃跑了，倭寇乘机直逼王京，麻贵另外派遣副将解生守稷山，朝鲜也命令都体察使李元翼出忠清道拦击敌前锋，解生颇有斩获的功劳，参将彭友德也在青山击破敌人。日军将领小西行长退守井邑，加藤清正还兵庆州。
经略邢玠、经理杨镐后到，分兵三协：左边为李如梅，右边为李芳春、解生，中间为高策。麻贵与杨镐率左右二协兵力专门攻打加藤清正。高策驻守宜宁，向东援助两协，向西扼制小西行长。各军到庆州，倭寇全都退守蔚山，李如梅引诱日军深入并将他们击败。加藤清正退保岛山，筑三砦自守。游击茅国器率敢死队拔取敌砦，斩首六百五十级，各军于是进围岛山城。岛山城刚用石筑成，很坚固，将士仰攻死亡很大，包围了十天，倭寇突然袭击并击败解生部。
小西行长前来增援，明朝九将之兵都被击溃，敌人在江上树立旗帜，杨镐非常害怕，仓惶撤军，却向朝廷报捷。不久，失败的情形传来，皇帝罢免杨镐，责令麻贵立功赎罪，麻贵与刘綎、陈璘、董一元分兵四路。麻贵居东，抵挡加藤清正，多次战斗，都有战功。时丰臣秀吉去世，明军更加努力进攻，加藤清正逃跑，麻贵于是进入岛山、西浦各路，麻贵率师凯旋，提升右