宫树立淫威，极力勾结保姆客氏，伺候陛下饮食起居；到处安插傅应星、陈居恭、傅继教等人，窃取朝廷的消息。真是到了天怒人怨的地步，所以杨涟不惜冒着粉身碎骨的危险极力向陛下陈述。当今魏忠贤的种种罪状，陛下全都揽在自己的身上，代他承担责任。恐怕魏忠贤之所以能够得到皇上的旨意，就是因为诏书出自魏忠贤之手，而杨涟的上疏，陛下尚且没有来得及阅读吧？陛下贵为天子，把三宫嫔妃的性命全都交给魏忠贤和客氏，怎不让人寒心。陛下说宫禁之中严守机密，外廷怎能知晓。枚乘有一句话，说：‘想叫别人不知道，不如自己不去做。’没有做了事情别人不知道的。又说把身边的人赶走了，皇帝将会被孤立起来。陛下的身体，大小臣属都拥护爱戴，何必依靠魏忠贤？假使魏忠贤、客氏一天不离开，恐怕宫中左右都是魏忠贤、客氏的人，不是陛下的人，陛下真正在上面被孤立了啊。”
魏忠贤得到奏疏很愤怒，假传圣旨痛责他，尚未定罪。大学士魏广微与魏忠贤内外勾结，狼狈为奸，魏大中常想检举他。正好十月冬祭，魏广微迟到，却态度傲慢。魏大中于是上疏弹劾他。魏广微不悦，遂与魏忠贤联系愈加紧密。魏忠贤的权势日益增大，但由于廷臣交相攻击他，魏忠贤表面故作收敛，且按照各人上疏的要求去做，而在暗地里等待时机，等到吏部推举谢应祥巡抚山西，魏广微便唆使跟他的亲信陈九畴弹劾魏大中，原因是魏大中是谢应祥的门生，推举不公正，最终将魏大中贬官三级派往外地，并尽数驱逐以吏部尚书赵南星为首的东林党人。自此，国家大权全部归于魏忠贤一人之手。
魏忠贤的党徒梁梦环再次弹劾汪文言，将其打入监牢，镇抚许显纯亲自写供词上报，赵南星、杨涟、左光斗、魏大中以及李若星、毛士龙、袁化中、缪昌期、邹维涟、邓渼、卢化鳌、钱士晋、夏之令、王之寀、徐良彦、熊明遇、周朝瑞、黄龙光、顾大章、李三才、惠世扬、施天德、黄正宾等人皆受牵连。诬陷而杨涟、左光斗、魏大中、袁化中、周朝瑞、顾大章接受杨镐、熊廷弼的贿赂，魏大中定罪为受贿三千两，假传圣旨全部逮捕下狱。同乡的人听说魏大中被逮捕离开，号哭送他的人有几千。同年六月入北镇抚司监，许显纯严刑拷问，血肉模糊。魏大中自知难免一死，留《临危遗书》，嘱咐