芾诸名家法书,刊刻《戏鸿堂法帖》行世。
病休松江时期,他正值四十余岁的盛年,广闻博识,采集众长,悠居林泉,心闲手熟,创作了《葑泾访古图》《鹤林春社图》《浮岚暖翠图》《神楼图》《西湖八景图》《溪回路转图》等许多描绘江南风光的着名山水画。
神宗驾崩,朱常洛即位,是为光宗,启用董其昌为太常少卿,掌国子司业。期间,奉命修《神宗实录》。光宗执政一个月就驾崩,继任的明熹宗宠信魏忠贤与乳母客氏,董其昌被任命为南京礼部尚书,在任一年即辞官退隐,退隐“家居八载”。魏忠贤死,政局趋向清明,七十七岁的董其昌第三次出仕,“起故官,掌詹事府事”,阁臣周延儒遭温体仁排挤,离开内阁,温体仁在魏忠贤余党的鼓动下,掀起党争,排斥东林,董其昌又乞求致仕。
从三十五岁走上仕途到八十岁告老还乡,为官十八年归隐二十七年,与家乡松江的先贤陆机崇奉“士为知己者死”相比,董其昌把明哲保身的政治智慧用得出神入化。他以科举入仕进入精英阶层,既结交东林派、公安派,又与反东林党人惺惺相惜,在松江寓所逝世,享年八十二岁,后来葬于吴县渔洋湾董氏坟茔。