宗建、侍郎陈邦瞻，御史马鸣起、给事中侯震旸先后极力谏阻，都受到斥责。给事中倪思辉、朱钦相、王心一又向朱由校进言，都被贬往外地。他们都还没有指向魏忠贤呢，魏忠贤于是劝朱由校选择武阉人，制造火器在宫内操练，并秘密勾结大学士沈翭为援。他又每天引导朱由校沉溺于倡优声伎、狗马射猎之中，刑部主事刘宗周首先弹劾他，朱由校大怒，赖大学士叶向高相救，才得以获免。
神宗朱翊钧在位年久，对政事已感到厌倦，章奏多不批阅，廷臣逐渐建立起门户，他们以过激惊人的言论为时尚，借国本之争，指斥宫禁，宰辅大臣被言官弹劾攻击，常常被迫称病引退。吏部郎顾宪成在东林书院讲学，海内士大夫多依从他，“东林”之名从此而始。后来“梃击”、“红丸”、“移宫”三案发生，整个朝廷如同在打官司，与东林党相对抗的，众人便把他们为邪党。大臣几乎全被罢免斥退，有识之士已担忧搞得过激将要发生变乱。
魏忠贤势力形成后，他的党徒果然图谋要依靠他排挤东林党，而徐大化、霍维华、孙杰首先依附魏忠贤，刘一燝和尚书周嘉谟都被孙杰弹劾而离去。当时，叶向高、韩火广正在辅政，邹元标、赵南星、王纪、高攀龙等都官居高位，左光斗、魏大中、黄遵素等人在言路，他们都全力主持清议，魏忠贤没能得逞。
朱由校评修庆陵功，荫封魏忠贤的侄儿为锦衣卫指挥佥事，给事中惠世扬、尚书王纪评论沈翭与魏忠贤、客氏交通，结果都被贬职。正好初夏下冰雹，周宗建说冰雹下得不合时令，是魏忠贤谗言和邪恶造成的，修撰文震孟、太仆寺少卿满朝荐也相继这样说，都被罢免。
魏忠贤引荐私人魏广微为大学士，令御史郭巩攻讦周宗建、刘一燝、邹元标以及杨涟、周朝瑞等人保举熊廷弼，说他们袒护奸邪之徒，误了国家。周宗建反驳郭巩受了魏忠贤的指使，御史方大任也助宗建攻击郭巩和魏忠贤，但都不获胜。这年秋，朱由校诏令魏忠贤和客氏的儿子侯国兴所庇荫的锦衣官准予世袭，兵部尚书董汉儒、给事中程注、御史汪泗论纷纷劝谏，朱由校不从。
魏忠贤更加肆无忌惮，将内操军增加到一万人，内穿甲衣出入宫禁，恣意作威施虐。他假传圣旨将朱常洛的选侍赵氏赐死。裕妃张氏有身孕，客氏阴谋杀死了