候，乔伊小姐给小智一封信。
“亲爱的小智，由于你是一位令人敬佩的训练家，我想邀请你来参观我最新研发的对战系统，请尽快来到我的研究城堡，杨古博士。这信上是这么说的。”
“新的对战系统，听上去很有趣的样子。”
“是啊，我们一起去看看。”
三人穿过森林来到了杨古博士的研究城堡，这里地面上有类似于照明灯的东西，
系统:“这个装置能制造幻影神奇宝贝，任何神奇宝贝都能被复制特性和招式也能随意转换，非常棘手。”
小霞和大木博士也受邀请来到这里。
小智看到小霞和大木博士也在，脸上露出惊喜的神情。“小霞，大木博士，你们也收到邀请啦！”
小霞笑着跑过来，亲昵地挽住小智的胳膊，“是啊，听说有新的对战系统，我可不想错过。而且，也想看看你呢。”
一旁的小遥看到这一幕，微微撅了撅嘴，但还是走上前友好地和小霞打招呼。
大木博士说道:“这个新的对战系统听起来很有研究价值。”
杨古博士这时走了出来，热情地招呼大家：“欢迎各位的到来，那我们就开始介绍一下这新的对战系统吧。”
众人跟着杨古博士来到了一个巨大的对战场地，场地中央闪烁着奇异的光芒。杨古博士操控着手中的设备，瞬间，场地中出现了几只幻影神奇宝贝。
“大家请看，这些就是幻影神奇宝贝。它们的实力不容小觑，现在就请几位训练家来体验一下对战吧。”杨古博士说道。
小智派出了皮卡丘
小霞和小遥对视了一眼，也都不甘示弱。小霞派出了宝石海星，小遥则派出了火焰鸡。
随着杨古博士一声令下，对战正式开始。幻影神奇宝贝们迅速发动攻击，皮卡丘灵活地闪避着，然后使出了十万伏特；宝石海星也不甘落后，用出了水炮；火焰鸡则喷出熊熊火焰，与幻影神奇宝贝展开了激烈的对抗。
遥控器突然爆炸幻影神奇宝贝们消失，一个神秘人出现他拿出另一个遥控器又召出很多幻影神奇宝贝。
“杨古博士你的幻影系统已经正式被我接收了，自我介绍一下我是幻影的主谋者。”